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RSS订阅原创 基于matlab批量进行文件重命名
想要把下图的文件按照“组别+序号”进行重命名，即修改为“MBI001,MBI002...MBI011,MBI012,这样命名为了后续图像按顺序处理方面。最近在整理影像数据，需要对文件进行批量重命名，1.先切换工作路径至需要重命名的文件夹。
2023-07-22 15:19:57
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原创 基于matlab批量提取某一文件夹下文件名
3.双击打开该文档，接着输入命令行dir *.*/b>目录清单.txt.5. 修改扩展名txt为bat，回车进行确定，弹出提示信息继续确定即可。6. 双击运行该文件即可，该文件夹下的文件名即被存储在该文档里。2. 找到需要提取的文件夹，在该文件夹下新建txt文本文档。4. 保存该文档，右键单击该文件，从下拉菜单中选择重命名。7. 多余部分删掉即可。1.打开matlab。
2023-07-17 14:19:30
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原创 基于spm12,DCM文件批量转为nii格式
【DICOM files】（红色1）:选择需要转换的文件夹，根据自己电脑的内存，适当选择一次性处理的个数，加入一组数据有300个文件需要转换，一次准备批量转换50个，那可以这300个文件分别存放在6个子文件夹（这样目的: 便于批量选择）5.单击A1,显示A1文件夹下的所有文件，这里每个子文件夹都代表一个人的T1图像，点击【Rec】，A1文件夹下所有的问价都会自动被选中，点击【done】完成，返回图3页面。点击图5的【Ed】,ctrl+A全选后删除，点击【Accept】,重新选择下一批即可。
2023-07-17 09:50:20
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原创 notepad++ 批量加逗号
第三步，弹出如下对话框，在【插入文本】填入‘，’，注意中英文符合，点击【确定】即可批量完成。如果数据少，可以一个个加，但如果有几百个呢....,批量处理数据时，可能需要在一列数据后面加逗号，如下图。第二步，鼠标放置工具栏【编辑】--【列块编辑】，第一步，鼠标放置第一行数据的末尾；接下来，我们三步完成批量操作。今天又get一个新技能，
2023-06-23 18:02:33
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原创 matlab 将文件夹中txt格式文件转换成‘.mat’格式
save([filelist(i).name(1:end-4),'.mat'],'fc')%把FC保存为.mat格式。
2023-05-19 14:41:24
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原创 corrplot包 画上下拼图
上图是今天晚上代码调试近2个小时的结果，很开心最终调试出来了，赶紧来这里记笔记。corrplot基础知识（参考corplot绘制SCI级相关性热图（基础知识） - 简书）##下面来看今天结果图的代码rm(list = ls())setwd("D:\\cerna\\correlation")#设置当前目录#导入数据文件Muldat=read.table("CIBERSORT_Score_dataset.txt",sep="\t",header=T,check.names=F,r...
2022-05-30 22:15:27
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原创 R语言 PDF文件损坏或打不开
最近在做ROC曲线，发现有的PDF文件打不开，提示‘‘已损坏或者打开格式不对”，第一段代码画的PDF可打开，第二段代码则的PDF文件一直打不开，捯饬了大半天，终于找到解决办法：1. 把原来的PDF文件删除，再重新运行代码，即可（前提代码正确）；2.或者重新命名PDF文件，再运行代码。出现PDF打不开的原因可能是在调试代码时，可能生成了错误的PDF文件，没有被及时删除，所以即使后来代码调试正确，如果原来的PDF文件没有被及时删除，新生成的PDF文件并不成及时更新，仍然是打不开状态。总之，要及时删除错误的PDF
2022-05-29 17:09:52
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原创 R语言学习笔记-文件读取和保存
1. 文本格式和CSV数据读取和保存读取.txtoptions(stringsAsFactors = F)immune <- read.table("data/pan_cancer_immune.txt", sep="\t",header=T, check.names=F)#单个列表形式group_list1 = read.table("data/GSE12_samplelist.txt",header = T,sep = "\t")保存文件write.tab.
2022-05-25 16:41:58
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原创 starbase 数据库使用 （miRNA预测LncRNA）
数据库网址：ENCORI: The Encyclopedia of RNA Interactomes.ENCORI: The Encyclopedia of RNA Interactomes.1. 打开链接，看到数据库首页2.点击‘miRNA target’ 下拉按钮，选择miRNA-LncRNA,如下图3. 点击后可见如下见面：4. 物种选择‘mouse’，‘microRNA’ 输入待查的miRNA，如mmu-miR-707，enter键确定5. 得到结果...
2022-03-24 15:25:42
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原创 不同种属之间 同源基因的批量转换（R语言）
具体代码如下#安装homologene这个R包install.packages('homologene')#加载homologene这个R包library(homologene)#我的列表是人类的基因列表options(stringsAsFactors = F)#读取代转换基因列表(如下图genelist1<-read.table("human.txt",header = T,sep = "\t")#将上述读入的数据框格式转换为字符串的列表格genelist2 &l.
2022-03-19 14:12:36
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原创 如何快速寻蛋白PBD的ID
如何在PDB数据库快速查找一个目的蛋白的ID?PDB数据库网址：RCSB PDB: Homepage左侧边栏有进一步选择物种等挑选项目，score一般降序，在根据需要挑选自己需要的，6EQX即为PBD的ID号。点击进去可查看该分子详细信息，也可下载后续分子对接分析等。...
2021-05-25 16:50:23
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空空如也
空空如也
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