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RSS订阅原创 使用matlab脚本进行基于spm12对于fMRI的批处理
通过matlab命令行，输入‘spm’，在spm gui上逐步添加以下参数以创建模板，先逐个将bacth editor面板添加以下模块，再单独设置参数。这批数据的TR，TA 扫描顺序 TA = TR-(1-TR/nslices)，时间层顺序设置，如果有每一层的扫描时间，就将每一层的时间都写进去。生成matlab代码之后，再根据自己的需要编写循环代码，代码最开始是这样的，需要将被试的id加进去。以上做完之后，重点来了，点击File -> Save Batch and Script。
2024-05-21 16:26:48
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原创 解决dcm2nii 的gui不能成功转换nii文件的方法
输入dcm2nii.exe的路径，空格，输入要转换的dcm原始数据的文件夹，回车，就能够在dcm原始数据文件夹中生成转换后的数据。
2024-05-21 16:08:45
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原创 git使用指南
冲突合并：合并分支时，两个分支在同一个文件的同一个位置有两套完全不同的修改，git无法决定我们使用哪一个，必须人为决定新代码内容。再次查看状态，git status,显示如下信息：红色的表示文件还没添加到暂存区，需要进行追踪，然后再添加到本地库。再次查看状态，git status,显示如下信息：红色的表示文件还没添加到暂存区，需要进行追踪，然后再添加到本地库。：添加到暂存区，git追踪文件的过程，暂存区的文件可以删掉，使用命令。创建别名：由于这个仓库的名字是一段网址，太长了，需要创建一个别名。
2024-05-21 15:58:36
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原创 linux系统安装apex
可能遇到的问题：TypeError:unsupported operand type(s)for+:'None Type 'and 'str。先下载安装包，先git到本地，如果没有Git 请先安装git,如果git网络错误请手动下载（不要直接pip install apex）export TORCH_CUDA_ARCH LIST="compute capability"再执行安装。如果错误仍然没有解决，这意味着conda可能不是完整版本，也就是nvcc还没有安装，因此可以尝试。
2024-05-20 09:35:08
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原创 c++笔记
short s;int i;long l;//方式一...//访问数组元素//10//方式二//初始化数组//利用循环输出i < 5;i++){//方式三//定义数组的时候，必须有初始的长度//可以不写数组的长度struct Student { //此关键字不可以省略int age;int score;} s3;//通过学生类型创建具体的学生//第一种方式//相当于创建对象s1.name = "张三";
2023-11-17 16:13:28
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原创 医学图像处理算法原理（图像滤波、图像配准、分割、皮质映射）
区域生长算法是在图像的感兴趣区域或目标区域选择一个点作为初始种子点，这个初始种子点通常为一个像素或一些像素点并在需要进行分割的范围内，然后在初始种子点邻域范围内搜索种子点，如果搜索到的种子点与初始种子点具有相似像素，那么将它们合并在一个区域内，然后将搜索到的种子点作为新的初始种子点重复上述过程，最终种子点区域将会越来越大，直到没有合适的种子点被搜索进来，当所有的种子点搜索判断结束，最后可以将图像的目标区域分割出来。与中值滤波不同的是，均值滤波采用的是线性的方法，通过平均整个区域的像素值来实现滤波功能。
2023-11-14 09:46:05
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原创 git使用手册
文件在四个工作区域的。冲突合并：合并分支时，两个分支在同一个文件的同一个位置有两套完全不同的修改，git无法决定我们使用哪一个，必须人为决定新代码内容。再次查看状态，git status,显示如下信息：红色的表示文件还没添加到暂存区，需要进行追踪，然后再添加到本地库。在自己的GitHub账号中点击如下图示，可以新建一个远程库，远程库的名字和自己本地仓库的名字尽量一致。：添加到暂存区，git追踪文件的过程，暂存区的文件可以删掉，使用命令。创建别名：由于这个仓库的名字是一段网址，太长了，需要创建一个别名。
2023-11-13 21:58:46
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原创 基于spm12的First_level分析
4. First-Level Analysis4.1 Review上图A是我们自己设计的实验设计模型，图B是模型中体素的时间序列，图C中的激活区域的活动状态符合我们所设计的时间序列。4.2 血流动力学响应函数（HRF）大脑皮层受到激活时，它的BOLD响应信号会增加。例如我们进行一个任务设计，呈现出规律的刺激，那么我们大脑某个体素也可能与这个设计中的模型一致。大脑中BOLD响应的形状可以用一个叫做伽马分布的数学函数来建模。当Gamma分布的参数与大多数实证研究观察到的BOLD反应最匹配时.
2022-02-18 21:13:32
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原创 基于spm12对fMRI数据分析
任务描述这批数据来自于spm12（https://tinyurl.com/scelanz）官网，被试需要做2个runs，如下图所示，需要对箭头的方向做出反应，箭头朝右就按右键，朝左按左键，这批数据中有被试的反应时，准确率，可以在此文件夹用txt形式打开(sub-01_task-flanker_run-2_events.tsv)。2.数据整理2.1 观察结构像和功能像在MATLAB的命令窗口行输入 spm fmri我们还需要将*.gz数据进行解压，可以用命令gunzip('*.g..
2022-02-18 21:04:15
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原创 基于spm12对fmri数据的分析
任务描述这批数据来自于spm12（https://tinyurl.com/scelanz）官网，被试需要做2个runs，如下图所示，需要对箭头的方向做出反应，箭头朝右就按右键，朝左按左键，这批数据中有被试的反应时，准确率，可以在此文件夹用txt形式打开(sub-01_task-flanker_run-2_events.tsv)。2.数据整理2.1 观察结构像和功能像在MATLAB的命令窗口行输入 spm fmri，我们还需要将*.gz数据进行解压，可以用命令gunzip('*.gz'.
2022-01-18 15:43:40
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医学图像处理软件-fsl软件安装
2023-11-20
空空如也
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