《用Matlab和SPM批量处理被试的经验总结》

鉴于自己在处理数据过程中写了一些小的程序和得到了一些小的感悟，为了方便自己查找，也为了方便和其它同仁交流，特此开一个目录贴。其内容可能包括批量处理，统计分析和原理探讨等诸多方面。

这是个经验贴，谈不上是严肃的教程，也毫无权威性，乃至毫无正确性之保证，仅供和大家交流之用。当然，本着认真负责的精神，如果有任何错误，请阅读者以回帖的方式告知在下，在下一定及时更正。

• 如何从原始图像查看扫描参数
• 用SPM处理多个被试多个run的初步介绍
• SPM批量预处理的升级版以及用DARTEL进行标准化
• 预处理之后进行quality check的方法
  画头动曲线的代码
  配准和标准化效果检查的代码
  检查功能像质量的代码
• SPM中批量统计分析的升级版
• SPM建模中的implicit baseline是什么
• 把T值激活图转换成Z值激活图的代码及说明
• 用matlab处理fMRI配套行为实验结果的示例代码
• 用matlab处理行为实验结果并生成 .mat文件供SPM第一层分析使用
• 什么是mask，如何做mask
• 什么是ROI，如何做ROI以及批量提取ROI中% signal change和contrast value的示例程序
• 如何画ROI的百分比信号变化(% signal change)的曲线
• VBM分析中，modulation的作用？如何计算全脑的灰质、白质和脑脊液的体积？如何提取ROI中的灰质体积？
• 关于SPM第二层的flexible factorial的一些看法
• 对图像翻转左右的代码（结构像和功能像都可以用）
• 用matlab代码绘制漂亮的大脑激活图 （2D版）
  用matlab代码绘制漂亮的大脑激活图 （3D版）

转载：http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=25625&page=1&extra=#pid158525