原标题:一款好用的进化树可视化编辑软件
iTOL(Interactive Tree Of Life)是一个在线显示和操作的进化树工具。我们可以添加很多自定义的项目,丰富和完善自己的进化树,比如添加柱状图、蛋白结构域、heatmap、基因平行转移(horizontal gene transfer)等。今天讲一下iTOL的具体操作步骤。
网址:http://itol2.embl.de/
打开网址后,iTOL的主界面是酱紫的:
iTOL简介:
目前iTOL版本是3.0
必要工具:带有flash7以上的浏览器,建议用chrome、 firefox、 opera、 safari等,IE(强烈不建议)必须7.0以上版本
必须注册才能构建自己的工作目录
输入主文件:进化树文件(.nwk),最好带有bootstrap的文件
输入辅文件:有一定标准格式的其他文件(下文有示例)
iTOL菜单栏:
iTOL操作步骤:
注册 /登陆
新建工作区(workspace)