python获取window共享目录列表_利用Python获取DICOM RTstructure勾画列表

最新推荐文章于 2022-07-14 20:42:27 发布

商厚泽

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文章标签： python获取window共享目录列表

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42458937/article/details/113313565

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本文介绍如何使用Python读取Windows共享目录中的DICOM RTstructure文件，并获取勾画列表。通过修改load_scan()函数，添加条件判断t.Modality == 'RTSTRUCT'，读取RTstructure文件，然后解析StructureSetROISequence下的ROIName获取勾画名称。以HNSCC_01为例展示具体操作，并提供相关文件供读者实践。

摘要由CSDN通过智能技术生成

在《利用Python打开DICOM CT文件》一文中，我们利用pydicom.dcmread()读取了CT图像。本文中我们将修改load_scan()函数来读取RTstructure文件并获取勾画列表

1. 打开Jupyter notebook，导入需要的科学包

import numpy as npimport mathimport pydicomimport osimport matplotlib.pyplot as pltimport scipy.ndimagefrom skimage import measure, draw

2. 在load_scan()加入t.Modality == 'RTSTRUCT'作为判断读取RTstructure文件

def load_scan(path):    temp = [pydicom.dcmread(path + f) for f in os.listdir(path)]    RT = [t for t in temp if t.Modality == 'RTSTRUCT']    slices = [t for t in temp if t.Modality == 'CT']    slices.sort(key = lambda x: int(x.InstanceNumber))    try:        slice_thickness = np.abs(slices[0].ImagePositionPatient[2] - slices[1].ImagePositionPatient[2])    except:        slice_thick