首先介绍下APA，选择性多聚腺苷酸化(Alternative Polyadenylation，APA)是真核生物中普遍存在的一种重要的转录后调控机制，其对mRNA的稳定性、细胞内定位和蛋白翻译效率具有调控效应。而一些单核苷酸多态性(SNPs)可能通过失调APA而参与肿瘤的发生和发展。最近，华中农业大学龚静教授研究团队开发了一个在32种癌症类型探究SNP对APA事件影响的分析方法-apaQTL，并构建SNP2APA数据库用于浏览、搜索和下载apaQTL数据。
该数据库网址为： http://gong_lab.hzau.edu.cn/SNP2APA/
该数据库中肿瘤样本的基因型数据来自于TCGA数据库，APA数据下载于TC3A数据库。并且从TCGA数据库下载了患者生存时间等临床数据。下面跟小编一起来看看如何使用吧。 1.浏览与检索 在搜索框中输入你要找的SNP、基因或APA事件，就可以得到想要的结果，结果是以cisapaQTLs、trans-apaQTLs、survival apaQTLs和GWAS-apaQTLs四个动态表的形式呈现出来。例如搜索“CDV3”，就可以得到包括SNP ID、SNP基因组位置、SNP等位基因、APA事件、APA基
该数据库网址为： http://gong_lab.hzau.edu.cn/SNP2APA/
该数据库中肿瘤样本的基因型数据来自于TCGA数据库，APA数据下载于TC3A数据库。并且从TCGA数据库下载了患者生存时间等临床数据。下面跟小编一起来看看如何使用吧。 1.浏览与检索 在搜索框中输入你要找的SNP、基因或APA事件，就可以得到想要的结果，结果是以cisapaQTLs、trans-apaQTLs、survival apaQTLs和GWAS-apaQTLs四个动态表的形式呈现出来。例如搜索“CDV3”，就可以得到包括SNP ID、SNP基因组位置、SNP等位基因、APA事件、APA基
最低0.47元/天 解锁文章
1057
被折叠的 条评论
为什么被折叠?
到【灌水乐园】发言
