数据库生存曲线_工具篇|肿瘤突变研究再添利器SNP2APA数据库,你真的要懂它!...

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今天给大家分享一个评价SNP对于 APA 事件影响的数据库-SNP2APA,下面我们一起了解一下这个数据库收录了哪些信息以及数据库的具体操作方法吧。SNP2APA数据库连接:http://gong_lab.hzau.edu.cn/SNP2APA/

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生物学背景

选择性多聚腺苷酸化(Alternative Polyadenylation,APA)是真核生物中普遍存在的一种重要的转录后调控机制,研究表明APA能够调控mRNA的稳定性、细胞内定位和蛋白翻译效率。最近的研究表明,一些单核苷酸多态性(SNPs)可能通过失调APA而参与肿瘤的发生和发展。

华中农业大学龚静教授研究团队开发了一个在32种癌症类型探究SNP对APA事件影响的分析方法-apaQTL,并构建SNP2APA数据库用于浏览、搜索和下载apaQTL数据。

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