伤口愈合实验(Wound healing assay)是一种操作简单、经济实惠的研究细胞迁移/肿瘤侵袭的体外试验方法,在SCI论文中得到了广泛的使用【1】。
如何分析划痕实验结果却令很多人头疼!
划痕实验常见的统计指标是统计伤口愈合百分比(Wound healing percentage)和划痕宽度。
伤口愈合百分比本质上是一种面积分析,半夏在往期已经给大家分享过30秒搞定划痕面积分析,有兴趣的童鞋可以自行查看!
划痕面积的基本分析步骤为:
对划痕图片进行Process -> Smooth平滑后进行Process -> Find Edges寻找边缘,再使用Image -> Adjust -> Threshold,阈值选定后进行划痕面积分析:
划痕面积的分析相信大家已经很熟悉了,然而使用ImageJ分析实验划痕宽度却困难重重!在网络上我注意到有很多人都对划痕宽度计算心存疑惑:
关于宽度计算目前常用的方法是使用Plugins -> Analyze -> Grid添加等距的水平线(Horizontal lines)或是垂线,再沿着水平线或是垂直线手动画出划痕宽度,再使用Analyze -> Measure进行计算:
这种方法存在缺点:
- 手动画线起点和终点欠精确;
- 添加的等距水平线数量有限,得到的平均宽度不准确;
- 工作量大,浪费时间。
01 基础知识准备