AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题

最新推荐文章于 2024-06-03 17:21:40 发布
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分类专栏： 生信软件踩坑系列
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AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题


先非常抱歉关于回复慢的问题，我的确是没怎么关注csdn这边博客上的回复，之后我会尽量及时回复的。autodock不是我本人平时工作中常用的软件，但有时小伙伴会用到，并遇到bug。发布出来之后就没再维护过任何一次的老代码出问题这不是挺正常的。。。所以
如题，之前我万万没想到会遇到闪退问题，是我一位同学遇到的，于是顺便把安装教程一起写了。考虑到生物系的小伙伴主要是电脑小白，一水的windows，我这里用win10系统进行讲解。使用其他系统的小伙伴参考着自己研究一下也能搞定，我就不讲那么细了（用其他系统的肯定自己有本事正常安装吧~）。

AutoDockTools

AutoDock是分子对接常用的一款分子模拟软件，对于生物信息学和计算生物学研究者而言，这款软件我们可以用来研究蛋白质或其他生物大分子是如何与小分子结合并发挥作用的。
在这里插入图片描述
AutoDockTools(ADT)是用来运行AutoDock的图形界面（GUI）程序，本身使用python2.5解释器运行（不需要特别安装，ADT的安装包中自动安装了python2.5）

安装AutoDock

进入官网之后进入其下载界面，或者直接去我给出的链接，选择合适的版本，分别下载

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在做实验的时候，要使用Autodock这个软件（虽然这软件有点老）。到网上随便找了个安装教程，安装完autodock、autodock_vida、mgltools后，桌面也创建了快捷方式。然后点击下图红框的autodock时，loading加载在10%左右不动，然后程序加载页面连同控制台一同闪退。下面来讲讲如何解决闪退问题。
autodock使用时闪退
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运行adt时弹出以下界面，摁下enter后就闪退，该怎么解决？
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08-06 646
AutoDock是一款广泛用于分子对接的自动化软件，下面将自己个人总结的对接流程做出如下分享，希望能帮助到AutoDock刚安装上的友友，如果安装出现问题或者闪退可以看我这篇文章——以上就是本人解决问题的全过程了，后续会更新其他有关的教程。有问题的友友，可以关注私聊我哦。
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1. 下载 Autodock Vina 可以从官方网站下载最新版本的 Autodock Vina：http://vina.scripps.edu/download.html 或者使用以下命令下载： ``` wget http://vina.scripps.edu/download/autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz ``` 2. 解压 Autodock Vina 使用以下命令解压下载的文件： ``` tar -zxvf autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz ``` 3. 安装依赖项 Autodock Vina 需要依赖一些库，使用以下命令安装这些库： ``` sudo apt-get install libxt-dev libxext-dev libgl1-mesa-dev ``` 4. 编译 Autodock Vina 进入解压后的目录，使用以下命令编译 Autodock Vina： ``` cd autodock_vina_1_1_2_linux_x86/bin make ``` 5. 安装 Autodock Vina 为了方便使用，可以将 Autodock Vina 的可执行文件添加到 PATH 环境变量中： ``` export PATH=$PATH:/path/to/autodock_vina_1_1_2_linux_x86/bin ``` 6. 测试 Autodock Vina 使用以下命令测试是否安装成功： ``` vina --help ``` 如果输出了 Autodock Vina 的使用说明，则说明安装成功。
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