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RSS订阅原创 具有恒电势计算功能的lammps版本编译（含CONP2、intel加速包和Colvars）
具有恒电势计算功能的lammps版本编译（含CONP2、intel加速包和Colvars）
2022-08-24 01:42:05
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原创 linux编译lammps (intel mpi) + Voronoi + Colvars package的安装
linux编译lammps(intel_mpi) + Voronoi package的安装2021-12-23 By Junwu Chen随着时间的变更，lammps版本提升、编译器更新等原因，本教程可能不会完全适用1. 下载lammps最新稳定版源码包（可自行下载需要的版本的源码包:官方;github）wget方式下载（网络等问题可自行下载后上传服务器）：wget https://lammps.sandia.gov/tars/lammps-stable.tar.gz --no-check-cer
2021-12-23 17:23:59
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原创 解决PyG (PyTorch Geometric)库安装以及import时sklearn报错等问题
解决PyG (PyTorch Geometric)库安装以及import时sklearn报错等问题2021-3-26 By Junwu Chen at CAS IPE, Beijing1.安装pytorch由于我们组服务器的linux系统版本太老，glibc版本低于2.17且没有root权限，所以我通过conda的方法安装pytorch（安装PyG前需要先安装torch）。conda安装pytorch的方法可以见我的博文。2. 安装PyG安装方法可见官方手册。如我输入的安装命令为：pip in
2021-03-26 10:40:36
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原创 解决pytorch (torch) glibc 2.17 依赖问题
解决pytorch (torch) glibc 2.17 依赖问题2021-3-26 By Junwu Chen at CAS IPE, Beijingpytorch是常用的深度学习的python库，但在linux系统上安装时，会需要满足glibc >= v2.17的条件才能正常使用。这对许多linux系统版本较老且没有root权限的小伙伴们来说是一个很头疼的问题。我之前也在网上找了很多的解决方法，大部分都是通过在用户文件夹下自行编译高版本的glibc，然后通过设置环境变量或动态库路径来绕过本地的
2021-03-26 10:09:25
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原创 linux安装lammps(intel mpi)配合DeePMD-kit
linux安装lammps(intel_mpi)配合deepmd2021-03-15 By Junwu Chen参考教程：http://t.cn/A6tmS3Aw随着时间的变更，lammps版本提升、编译器更新等原因，本教程可能不会完全适用1. 下载lammps最新稳定版源码包（可自行下载需要的版本的源码包:官方;github）wget方式下载：wget https://lammps.sandia.gov/tars/lammps-stable.tar.gz --no-check-certific
2021-03-19 15:18:48
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原创 安装deepmd套件、deepchem、rdkit等软件包的python环境
安装deepmd套件、deepchem、rdkit等软件包的python环境2021-03-18 By Junwu Chen来自我的github方法1 (Method 1)1. 安装anaconda或miniconda (install anaconda/miniconda)2. 用conda创建python3.6的虚拟环境 (create a python3.6 virtual environment by conda):conda create -n deepc python=3.6 li
2021-03-19 15:08:02
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原创 化学标识符(Chemical Identifier)获得和转换
化学标识符(Chemical Identifier)获得和转换化学数据库（及其API）、软件和编程等方式，用于获取或转换化学标识符，如SMILES，InChI，标准化学名称，CAS号码等等
2021-03-19 14:58:44
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空空如也
空空如也
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