ggcor安装失败

已于 2023-08-17 18:45:54 修改
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于 2023-08-17 18:36:09 首次发布
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首先安装devtools：
install.packages(“devtools”)
接着安装开始安装ggcor：
devtools::install_github(“Github-Yilei/ggcor”)
顺利解决~

devtools::install_github("eliocamp/ggnewscale")

也顺利安装~

linkET | 完美解决ggcor安装失败方案（附教程） Science神图
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我发现使用BiocManager::install()无法安装ggcor，开始有点诧异，因为我觉得BiocManager应该可以安装所有包，之后在网上也找到别人的解决方法，记录一下。 首先安装devtools： install.packages(“devtools”) 接着安装开始安装ggcor： devtools::install_github(“Github-Yilei/ggcor”) 顺利解决问题。
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在linux中关于R包devtools的安装所遇到的问题及解决方法
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百度 R project 或者 http://www.r-project.org/ 点download, Packages 下的CRAN 点Download R 3.0.2 for WIndows  选择一个镜像即可 另：在http://www.r-tutor.com/ 下有相关tutorial
一篇SCIENCE文章的相关分析基于最新ggcor绘制方法与示例数据
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顶楼膜拜houyunhuang大佬，基于ggcor最新包 #zlab #zhoujian-2020 #linux转biom到TXT #biom convert -i otu_table.biom -o otu.txt --to-tsv #准备好环境因子表格 #devtools安装ggcor,建议通过原生R安装，R-studio安装会报错。 if(!require(devtools)) install.packages("devtools") if(!require(ggcor)) devtool.
【mantel test R 语言实现】
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左边4个点表示4个分组，注意：点虽然只有一个，但表示的是矩阵数据！右边每个理化因子之间做相关性热图，颜色表示相关系数在通过manlel test，将左边矩阵与每个理化因子相关联注意：左边可以是一个大矩阵，也可以采用某些方法划分成若干小矩阵中间连线部分的宽窄和颜色分别代表r的统计量和显著性p值1.如果你有三个物种的数据和环境理化因子数据，你想知道哪些理化因子分别对三个物种影响最大？（当然也不一定要物种数据，可以换成其它）2.探索不同环境中的酶活性与理化因子间的关系。
ggcor替代包：linkET，相关图，mantel test可视化
医学和生信笔记的博客
09-15 5019
本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 在几年前出现了一个ggcor包，可以用来可视化mantel test的结果，最开始还可以通过cran安装，不过后来也不行了，而且这个包由于一些原因已经停止维护了，最近的更新是2年前了！ 但是那张图却一直很风靡。。。其实原作者已经开发了新的包用于可视化mantel test，名字叫linkET，只是由于缺少宣
ggcor安装与使用
最新发布
09-27
"ggcor"是一个用于生成高维复杂网络图形的R包，它扩展了基础的`ggplot2`库的功能。安装和使用`ggcor`通常包括以下几个步骤： **安装**： 1. 首先，你需要确保已经安装了R和`devtools`包，如果没有，可以分别通过`install.packages("R")`和`install.packages("devtools")`进行安装。 2. 使用`devtools`来安装`ggcor`，可以在命令行输入： ```sh devtools::install_github("thomasp85/ggcor") ``` 这会从GitHub仓库下载并安装最新版本。 **使用**： 1. 安装完成后，加载`ggcor`包： ```r library(ggcor) ``` 2. `ggcor`主要通过`ggcorr()`函数创建热力图表示两个变量之间的相关系数矩阵，例如： ```r ggcorr(mtcars[, c("mpg", "disp", "hp", "wt")]) ``` 这里`mtcars`是一个内置数据集，你可以用自己的数据替换。 3. 可以进一步定制颜色映射、标题、网格线等，参照`ggplot2`的基本语法。 **相关问题--**: 1. ggcor支持哪些类型的网络图形？ 2. 如何调整ggcorr热力图的颜色主题？ 3. ggcor能否处理非数值型数据？
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