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CellMarker | 人骨骼肌组织细胞Marker大全!~(强烈建议火速收藏!)

让chatGPT来帮你读吧!🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤗 boxjitter | 完美复刻Nature上的高颜值统计图。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2024.05.06 ·
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MendelianRandomization | 孟德尔随机化神包更新啦!~(一)(小试牛刀)

这里需要说明一下哦,不是所有的参数都需要填的,这个需要根据你后面用到的方法。🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2023.12.30 ·
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Monocle 3 | 太牛了!单细胞必学R包!~(五)(差异分析之聚类比较与模块鉴定)

为了研究哪些基因在不同的簇中表达不同,我们可以使用之前介绍的回归分析工具。这里可以看到神经元有许多亚型,所以也许不同的神经元簇对应着不同的亚型。🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!还是前面一套老操作,具体的就不讲述了,不清楚的翻看之前的教程吧。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2023.12.02 ·
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Monocle 3 | 太牛了!单细胞必学R包!~(三)(建立单细胞轨迹)

比如,对感染的反应时,固有免疫细胞和基质细胞会有非常不同的初始转录组,对感染的反应也很不同,所以它们应该是同一轨迹的一部分。单细胞转录组、蛋白组、表观组学等单细胞技术的发展为研究细胞周期、细胞分化等细胞动态过程提供了新的机会。)的方法可以根据测序的细胞之间表达模式的相似性对单细胞沿着轨迹进行排序,模拟细胞动态变化的过程。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~
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发布博客 2023.11.04 ·
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Monocle 3 | 太牛了!单细胞必学R包!~(二)(寻找marker及注释细胞)

昨天又是不睡觉的一天,晚上还被家属讲了一通,理由是我去急诊了,没有在办公室待着,他老公疼没人去看。🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!好的,说完家属就暴雷了,“这么大的医院就安排一个大夫值班吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!这个文件你也可以进一步的加工一下,根据你的生物学背景等。🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~然后我们进行一下手动注释,其实手动注释是最准的。
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发布博客 2023.10.28 ·
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Monocle 3 | 太牛了!单细胞必学R包!~(一)(预处理与降维聚类)

🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!这周的手术真的是做到崩溃,2天的手术都过点了。给结果排个序,这个就根据你自己的需要好了。
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发布博客 2023.10.20 ·
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CCPlotR | 轻松拿捏单细胞分析之细胞交互!~

让chatGPT来帮你读吧!🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤗 boxjitter | 完美复刻Nature上的高颜值统计图。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2023.10.14 ·
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ggkegg | 用这个神包玩转kegg数据库吧!~(一)

好久没更了,实在是太忙了,值班真的是根本不不睡觉啊,一忙一整天,忙到怀疑人生。🤣 chatPDF | 别再自己读文献了!🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!吧各位~ ✐.ɴɪᴄᴇ ᴅᴀʏ 〰
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发布博客 2023.10.07 ·
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Slingshot | 细胞分化轨迹的这样做比较简单哦!~(二)

群是同一群细胞,只是处于不同的分化状态而已,两者之间并没有明显的差异。,两者之间存在一个平滑的过渡,通过逐渐的转录组变化来改变细胞状态。🤨 Google | 谷歌翻译崩了我们怎么办!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!最近自己的确不太在状态,做事情有极强的拖延症,要振奋起来啦,🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~这样做是有一定的好处的,可以防止已知的细胞阶段被归类为。上次有小伙伴问做这个分析有什么用?
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发布博客 2023.08.20 ·
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Slingshot | 细胞分化轨迹的这样做比较简单哦!~(一)

让chatGPT来帮你读吧!🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!来确定轨迹,我们都需要一种方法来确定新细胞沿着先前构建的轨迹的位置。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!可能有时候,我们只想使用细胞的一个子集或者新的。
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发布博客 2023.08.19 ·
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Wordcloud | 风中有朵雨做的‘词云‘哦!~

搞好了,不得不说🏥里手握生杀大权的人,都在自己的能力范围内尽可能的难为你。🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!)教程,大家都说简单,但实际操作起来又有一些难度,一起试试吧。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~函数类似,但返回的是一个简化的对象,例如向量或矩阵。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2023.08.16 ·
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Chord diagram | 啧啧啧!~人人必会的Chord diagram你不来学一学吗!?

是一种用于表示图形的矩阵,其中每个元素表示两个节点之间是否存在边。在邻接矩阵中,行和列分别表示图形中的节点,矩阵的元素表示相应节点之间是否存在边。它是一种常用的图形表示方法,可以方便地进行各种图形算法和分析。了,完全搞不懂这些东西的初衷和理由,感觉自己的🍚里米又要少一些了。的同时也希望让我们按时上下班,周末双休,取消夜班,至于米少就少吧。这里就只讲一个小的修饰吧,也是大家常用的,比如修改配色。🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~在无向图中,邻接矩阵是对称的,因为如果有一条从节点。
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发布博客 2023.08.12 ·
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ggrisk | 高分文章必备的三图联动就这样轻松搞定哦!~(附完整教程)

🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤗 boxjitter | 完美复刻Nature上的高颜值统计图。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!各位小伙伴的暑假是怎么度过的呀,欢迎分享图片给我,也让我看下。🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!终于有时间更新了,忙碌的一周也是告一段落了。中还是比较多见的,可以相对直观的观察。
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发布博客 2023.08.04 ·
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Dendrogram | 今天是人见人爱、花见花开的环形Dendrogram!~(附完整代码)

🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤗 boxjitter | 完美复刻Nature上的高颜值统计图。🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~很久没有见过外面的世界了,世界那么大,我也想去看看!🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!🧐 rms | 批量完成你的线性回归。
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发布博客 2023.07.29 ·
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Circular lollipop | 哇咔咔!!!环形棒棒糖图好吃又好玩!~

🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~,包含为确实难以破解的密码放置标签所需的所有信息。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!添加到所有时间,为圆圈内的标签留下所需的额外空间。吧各位~ ✐.ɴɪᴄᴇ ᴅᴀʏ 〰
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发布博客 2023.07.16 ·
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superheat | 超级简单的热图绘制解决方案!~(二)(聚类和注释图的添加~)

🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!默认情况下,在聚类时,相应的标签会分组到聚类名称中(通常为。🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 CMplot | 完美复刻Nature上的曼哈顿图。🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!常用的类型有以下几种,我们一起看看吧。
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发布博客 2023.07.14 ·
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superheat | 超级简单的热图绘制解决方案!~(手把手教学~)(一)

画热图一直是一件既简单又复杂的事情,想画个普通的热图还是挺简单的,但是复杂热图就要费事的多了。🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 LASSO | 不来看看怎么美化你的LASSO结果吗!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~,还是比较好用的,但是最近发现了一个更简单的解决方案,🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2023.07.09 ·
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Barplot | 平平无奇的环形Barplot你掌握了吗!?~(附完整代码)

也越来越明白,为什么大家会说希望家里人身体都健健康康的,这个真的是最重要的事情了。不知道是不是人到中年了,事情也特别的多,能静下心来思考的时间越来越少了。让chatGPT来帮你读吧!🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!,颜值还是蛮高的,大家试试吧!
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发布博客 2023.07.02 ·
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GeSciLiVis | 想知道你感兴趣的基因有多少人在研究吗!?用这个包来解决吧!!!~

毕竟工欲善其事,必先利其器,好的工具可以极大地提高效率,降低你的疲劳感,哈哈哈哈哈哈哈。🤥 ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!🤗 boxjitter | 完美复刻Nature上的高颜值统计图。不知道各位小伙伴那里的温度怎么样,端午临近,各位有假期吗!🤩 ComplexHeatmap | 颜狗写的高颜值热图代码!🤩 RColorBrewer | 再多的配色也能轻松搞定!🤣 NetworkD3 | 让我们一起画个动态的桑基图吧~🤩 WGCNA | 值得你深入学习的生信分析方法!
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发布博客 2023.06.18 ·
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Same Symbol | 哇咔咔!!!盘点一下表达矩阵中重复基因的处理方法!~

这个问题的处理起来也简单也复杂,你可以随机取一个,可以都去掉,可以取最大值,可以取均值,仁者见仁,智者见智吧。动不动就问我们对医院的福利满意吗,对自己的收入满意吗,觉不觉得工作负荷太重了?这里需要注意一下哦,对于相同的基因,应该挑选行平均值大的一整行,而不应该打乱。接着是今天的正文,盘点一下我个人常用的几种处理重复基因的方法!,但实际上是挑选了平均值最大的一行,我个人也是比较喜欢这种方法。时经常遇到的一个小问题,就是重复基因名或者探针名的问题。再看一下重复的基因去掉了没有,好的,任务完成。
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发布博客 2023.06.11 ·
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