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原创 计算生物学习——Code_SMILES的向量表示_ChemBERTa(07.16)

模型在输入序列中随机遮盖(mask)一些令牌(tokens),然后预测这些被遮盖的令牌。参数越多,模型的容量越大,可以捕捉到更多的复杂特征,但也需要更多的计算资源来训练和推理。记得定义一下自己的local_model_path(文件夹(chemBERTa_files)所在的路径)这是在提示说我加载的模型不完整或有一些参数没有在预训练过程中保存下来。尝试加载模型时,遇到和之前一样的情况,用和之前一样ESM2的方法:本地加载。是模型池化层(pooler layer)的权重。根据错误信息,我加载的模型使用的是。

2024-07-17 17:57:56 974

原创 故障信号诊断——稳态幅度和稳态相位理论推导补充(07.15)

发现广义变换后的理论推导,比较模式化,按着步骤慢慢推导就可以了。广义变换(时间尺度变换)等式两边求期望(乘以。

2024-07-15 23:51:14 227

原创 读文献——Amplitude和Signal-to-Noise Ratio (SNR)解析式理论推导

主要目的是解释分数阶Langevin方程中噪声和记忆核的数学特性,并通过波动-耗散定理连接二者。特别强调Hurst参数的选择条件,以确保记忆核的正值特性。能描述具有异常次扩散的系统中的随机动力学。解释了记忆核和噪声之间的关系,并强调了这种方程在处理异常次扩散系统中的优势。:处理诸如 〈Z(t)x(t)〉这样的乘积的期望值。得输出幅度和信噪比(SNR)的精确表达式。的波动,建模为双态噪声,取值为。分数高斯噪声 (FGN)分数布朗运动 (FBM)还没学会推系数...

2024-07-12 18:01:56 226

原创 课程作业——精算统计_De Pril‘s & Kornya递推公式

以对角线11为例,当人在54岁死亡的概率q_1,赔付i_1的保单持有人数为400。得到的结果和书上进行对比(黄色部分是存在误差的,大概为0.0001。已知数据和结果,需要自己写出代码并跑出与书上结果相对应的结果。改变b_k_x函数中的2/3,可得到K2,K3对应得值。因为花了蛮多时间,特来留个纪念。

2024-07-08 13:28:10 181

原创 读文献——轴承故障诊断【07.05-07.07】

(e):阻尼系数(γ=0.2)、固有频率(ω²=1.0)、随机波动强度(σ²=0.2)、GST系数(λ=0.5)、故障频率fd=100Hz、D=0.5时,OAA随参数R的变化情况。(d):阻尼系数(γ=0.2)、固有频率(ω²=1.0)、随机波动强度(σ²=0.2)、参数R=720、故障频率fd=100Hz、D=0.5时,OAA随GST系数λ的变化情况。(f):阻尼系数(γ=0.2)、固有频率(ω²=1.0)、随机波动强度(σ²=0.2)、GST系数(λ=0.5)、故障频率。与图2(e)类似,但。

2024-07-08 12:32:40 671

原创 计算生物学习——Code_MolBERT(06.23-06.24)_问题待解决

为了方便,可以把整个文件夹下载,解压之后放进VScode中(也方便调整项目路径~)

2024-06-24 20:29:52 706

原创 计算生物学习——Code_ESM-2输出蛋白质的特征表示_解决无法用代码线上加载模型(06.20-06.21)

今天,根据大佬loong_XL指点去查看了源头代码,发现问题--解决问题

2024-06-21 17:22:29 2904

原创 计算生物学习——Code_PyTorch(06.15-06.19)

计算生物学习笔记1

2024-06-19 18:38:18 848 3

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