Loss-augmented Max-margin Constraint Generation(LAM-CG) algorithm

最新推荐文章于 2024-07-25 16:05:31 发布
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分类专栏： RNA结构预测 文章标签： 生物信息学 机器学习 数据挖掘 模式识别 算法
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43269419/article/details/121183701
版权

Computational approaches for RNA energy parameter estimation

Year: 2010
Authors: MIRELA ANDRONESCU, ANNE CONDON, HOLGER H. HOOS, DAVID H. MATHEWS, and KEVIN P. MURPHY
Journal Name: BIOINFORMATICS

Motivation

将最大间隔应用于CG模型中

Research Objective

改进估计能量参数的优化方法。

Background

Constraint generation(CG) approach

Method

在CG模型中，真实结构的自由能被要求少于其他结构的自由能。而在LAM-CG模型中，作者要求这两者之间自由能的差距要与两者结构相似性成比例。直观来讲，两者结构差距越大，自由能差距越大。

Future Work

  1. 研究不佳的预测结构与使用参数的相关性，从而提出一种更好的预测方法
  2. 对数据可靠性进行更好的理解，从而提升数据质量。
  3. 改善模型特征和能量方程
吊儿郎当的凡
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