ggplot2_可视化_速成

作者：Li_Yuhui
四川大学研究生在读

本文是R，ggplot2包学习的笔记，总结了大量优秀前辈的工作，对ggplot2进行结构性总结归纳，能够让新手快速上手，事实上，笔者是将其作为字典用的，忘记了，就翻一翻。
看完本文后，如果还是对ggplot2不清楚，欢迎来打脸。

ggplot2特点

• 采用图层的设计方式，有利于结构化思维
• 将表征数据和图形细节分开，能快速将图形表现出来，使创造性绘图更加容易，而不必纠结于图形的细节，细节可以后期慢慢调整
• 将常见的统计变换融入到了绘图中
• 有明确的起始(ggplot开始)与终止(一句话一个图层)，图层之间的叠加是靠"+"实现的，越往后，其图层越在上方
• 图形美观，扩展包丰富，有专门调整字体和公式的包，有专门调整颜色的包，还有专门用按钮辅助调整主题的包，总之，应有尽有

ggplot2基本概念

• Data数据， Mapping映射
• Scale标度
• Geometric几何对象
• Statistics统计变换
• Coordinate坐标系统
• Layer图层
• Facet分面
• Legend图例
• beautiful美化

ggplot2语法框架

绘图流程：

ggplot(data, aes(x = , y = )) +   # 基础图层，不出现任何图形元素，
  geom_xxx()|stat_xxx() +  # 几何图层或统计变换，出现图形元素  
  coord_xxx() +  # 坐标变换，默认笛卡尔坐标系     
  scale_xxx() + # 标度调整，调整具体的标度  
  facet_xxx() + # 分面，将其中一个变量进行分面变换  
  guides() + # 图例调整
  theme() # 主题系统  

共性映射与个性映射

• ggplot(data = NULL, mapping = aes())
• geom_xxx(data = NULL, mapping = aes())
• ggplot()内有data、mapping两个参数
  具有全局优先级，可以被之后的所有geom_xxx对象或stat_xxx()所继承(前提是geom或stat未指定相关参数)
• 而geom_xxx()或stat_xxx()内的参数属于局部参数，仅仅作用于内部
• 为了避免混乱，通常将共性映射的参数指定在ggplot(aes())aes内部，将个性映射的参数指定在geom_xxx(aes())或stat_xxx(aes())内部

几何对象与统计变换

• 几何对象geom_xxx(stat = ) 内有统计变换参数stat，统计变换stat_xxx(geom = )内也有几何对象参数geom
• 两种方法结果相同，几何对象更专注于结果，统计变换更专注于变换过程

library(ggplot2)
# 用几何对象作图
ggplot(data = NULL, mapping = aes(x = x, y = y)) + 
  geom_point(color = "darked", stat = "identity") # identity 表示没有任何统计变换
# 用统计变换作图
ggplot(data = NULL, mapping = aes(x = x, y = y)) +
  stat_identity(color = "darked", geom = "point") # geom_point(stat = "identity")与stat_identity(geom = "point")结果一样

aes与data参数

• aes参数用来指定要映射的变量,可以是多个变量，
• data参数表示指定数据源，必须是data.frame格式，其坐标轴变量最好宽转长，只能指定一个x轴和y轴，多个x列或y列不能使用调整图例。

geom_xxx()几何对象

常用的几种几何对象函数：

几何对象函数	描述	其它
geom_point	点图	geom_point(position = "jitter") == geom_jitter() 避免重叠
geom_line	折线图	可以通过smooth参数平滑处理
geom_bar	柱形图	x轴是离散变量
geom_area	面积图
geom_histogram	直方图	x轴数据是连续的
geom_boxplot	箱线图
geom_rect	二维长方形图
geom_segment	线段图
geom_path	几何路径	由一组点按顺序连接
geom_curve	曲线
geom_abline	斜线	有斜率和截距指定
geom_hline	水平线	常用于坐标轴绘制
geom_vline	竖线	常用于坐标轴绘制
geom_text	文本

ggplot2唯一不支持的常规平面图形是雷达图

其它几何对象查询：
ggplot2 part of the tidyverse
ggplot2 Quick Reference: geom
也可以用ls(pattern = '^geom_', env = as.environment('package:ggplot2')) 查询，但是没有图形示例

library(ggplot2)
ls(pattern = '^geom_', env = as.environment('package:ggplot2'))

柱形图和散点图是关键，并且与极坐标变换紧密相连，着重介绍柱形图和散点图，其它的原理和参数都类似

aesthetics specifications 美学参数 {}

能用作变量映射的包括：

美学参数	描述
color/col/colour	指定点、线和填充区域边界的颜色
fill	指定填充区域的颜色，如条形和密度区域， 第21到24号点也有填充色
alpha	指定颜色的透明度，从0(完全透明) 到 1(不透明)
size	指定点的尺寸或线的宽度，单位为mm
angle	角度，只有部分几何对象有,如geom_text文本的摆放角度, geom_spoke中短棒摆放角度
linetype	指定线条的类型
shape	点的形状, 为[0, 25]区间的26个整数
vjust	垂直位置微调，在(0, 1)区间的数字或位置字符串: 0=“buttom”, 0.5=“middle”, 1=“top” , 区间外的数字微调比例控制不均
hjust	水平位置微调，在(0, 1)区间的数字或位置字符串：0=“left”, 0.5=“center”, 1=“right” ， 区间外的数字微调比例控制不均

不常映射的参数	描述
binwidth	直方图的宽度
notch	表示方块图是否应为缺口
sides	表示地毯图的安置位置("b"底部, "l"左部, "t"顶部, "r"右部, "bl"左下角, 等等)
width	箱线图或柱形图的宽度，从(0, 1), 柱形图默认0.9即90%
lineend	表示指定宽线条端部形状，有3种："round"半圆形，"square"增加方形, "butt"默认不变， 常用于geom_path和geom_line几何对象
family	字体(Font face)，内置的只有3种：“sans”, “serif”, “mono”
fontface	字型，分为: "plain"常规体, "bold"粗体, "italic"斜体, "bold.italic"粗斜体。常用于geom_text等文本对象
lineheight	长文本换行行距, 常用于geom_text等文本对象

fill/color 颜色

R自身自持很多种方式的颜色，"颜色名称"和"HEX色值"最常用和方便，其它的需要扩展包
颜色名称如：
“white”, “azure”, “bisque”, “blue”, “black”, “brown”, “chacolate”, “coral”, “cornsilk”, “cyan”, “gold” ,
“darkgolden”, “orange”, “orchild”, “gray”, “grey”, “tomato”, “violet”, “wheat”, “yellow”, “pink”,
“purple”, “red”, “salmon”, “seashell”, “ivory”,“magentia”,"navy"等系列。
所有的颜色名称见： R_Color_Chart
如果对一组颜色进行映射的话，建议使用RColorBrewer等调色包，更加方便
RColorBrewer颜色板如下，左边为字符串编号，上下分为3个版块，分别为渐变色板Sequential，离散对比色板Qualitative，两极色板Diverging

# colors() # 调用所有内置颜色编号，名称
scales::show_col(colors()[1:6]) # show_col函数可以将颜色名称或HEX色值向量显示出来
# RColorBrewer包使用
library("RColorBrewer")
display.brewer.all() # 显示所有可用色板
display.brewer.all(type="seq")# 查看渐变色板

RColorBrewer使用方法：
通过函数brewer.pal(n, name)抽取色条名字为name的n种颜色，后面还可以用"[]"索引符号索取色块，
一个几何对象设置多种颜色只能在标度中设置，我们会在标度中继续讲解，例：

library("RColorBrewer")
display.brewer.pal(7, "PuRd") # 抽取PuRd色条7种颜色，其颜色色值范围没有变，只是色值间隔增大了
display.brewer.pal(9, "PuRd")[11] # 抽取PuRd色条11种颜色，其颜色色值范围没有变，指定色值间隔减小了

lin