备忘录 | LAMMPS coding tips分子动力学软件LAMMPS的代码小技巧和注意事项

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PART ONE - in script

1. 命令太长可以用 & 换行显示；

2. 注意output files命名，避免重名，尤其是多个算例在一个目录或文件夹（directory/，folder\）下运行的时候；

……（待续）

PART TWO - Manual_commands

simulation box

用周期性边界条件（Periodic Boundary Condition）的时候，可能有边界处对不齐、拼不紧凑的问题（对应的error我忘了sorry），这时候需要稍微调整下第一个region命令，试着放大或者缩小一点点，等边界对齐，那个error就会消失。

region box ...

region

units lattice v.s. units box

region ... units lattice

region ... units box

1. LAMMPS默认是units lattice；

2. units lattice的意思是用lattice本身为标尺创建region，一般用整数值，region的大小会随着lattice的改变而改变。units box是以绝对长度为标尺创建region，可以用小数，region的大小只跟设置region用的数值有关，不会随着lattice的改变而改变；

3. 如果你希望某个region的几何尺寸固定&#x