【MIMIC-CXR数据集】

已于 2024-06-04 17:46:25 修改
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文章标签： 数据库 图像处理
于 2024-06-04 17:13:14 首次发布
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MIMIC-CXR数据集（图像大小已转换为512）

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欢欢的科研笔记
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MIMIC-CXR数据集的下载
ZHANGQI98的博客
07-28 8513
MIMIC-CXR数据集的下载 第一步 首先你需要注册一个pyhsionet账号，并且使用这个账号获取到CITI证书，具体步骤见链接1 第二步 申请mimic的访问权限，具体步骤见链接1。发出的申请是由人工审核的，注意所以比较慢，大概需要1-2周甚至更多的时间 第三步 进入MIMIC-CXR官网https://www.physionet.org/content/mimic-cxr/2.0.0/，该网站是dicom格式的胸片数据集，简便版本jpg格式的链接：https://physionet.org/cont
胸部影像mimic-cxr数据集
qq_45190135的博客
04-04 1885
胸部影像mimic-cxr数据集
MIMIC-CXR数据集加载及配置
weixin_43762234的博客
04-13 997
其中 dicom_id：图片名；s+study_id：图片的上级目录（病人在不同时期的检查）；p+subject_id：图片的上上级目录也是病人的编码（这个文件夹内是这位病人在不同时期做的检查）；split：分为train、validate和test。这里我修改了mimic-cxr-2.0.0-split.csv文件，只留下了三个数据以便于展示。mimic-cxr-2.0.0-split.csv文件内容。这里我只需要用训练集，所以只加载了train。MIMIC-CXR数据集文件目录格式。
Dataset简记MIMIC-CXR: A LARGE PUBLICLY AVAILABLE DATABASE OF LABELED CHEST RADIOGRAPHS
u013368992的博客
01-23 2919
MIMIC-Diff-VQA
whaosoft143ai的博客
07-26 169
这张图像的主要异常是什么？为了保证数据集构建的质量，该研究主要遵循 “提取 - 检查 - 修改” 的步骤，首先通过正则表达式设定的规则对数据库报告中的关键信息进行提取，然后利用手动和自动的方法对提取结果进行检查，接下来对出现问题的地方进行修改使提取结果更加准确。同时，简单的标签只提供了单一的异常信息，无法反映临床疾病的多样性。MIMIC-Diff-VQA 数据集包括 164,654 张图片，和 700,703 问题，含盖 7 种不同的具有临床意义的问题类型，包括异常，存在，方位，位置，级别，类型，和差异。
MIMIC-IV-ED数据集介绍
weixin_36172141的博客
01-31 979
MIMIC-IV-ED 是一个大型的免费数据库，记录了2011年至2019年间急诊部门(ED)贝斯以色列女执事医疗中心的入院情况。该数据库包含约425,000个 ED 停留。生命体征，分类信息，药物协调，药物管理和出院诊断是可用的。所有数据都被确定为符合健康信息便携性和责任法(HIPAA)安全港条款。MIMIC-IV-ED 旨在支持各种各样的教育倡议和研究。
【MIMIC-IV/pytorch实战】基于word2vec、transformer进行英文影像报告文本分类
weixin_46523923的博客
01-24 2693
完成这个任务的完整流程可以分以下几步数据整理word2vec构建模型 数据整理 MIMIC-IV中的文本数据在MIMIC-CXR模块中，影像报告以txt格式储存，每份报告为一个txt文件，如下 病人与报告之间通过一个cxr-study-list表相关，通过这张表我们可以获取报告对应病人的其他信息，如是否死亡、患病等情况作为标签。 这部分程序主要完成两步， 一是通过疾病筛选患者，因为都是胸片报告，因此我筛选出肺癌患者 二是提取文本，并删除所有换行符，这步主要程序可见这篇博客： python导入txt文件并删
医学数据库MIMIC-III v1.4
05-01
多参数智能监测数据库（ＭＩＭＩＣ－ＩＩＩ）是一个免费开放的、公共资源的重症监护室研究数据库。 内容概要：本资源包含数据集中的三个表格，PATIENTS，CHARTEVENTS和LABEVENTS，表格的说明可参考 ...
mimic-tools:MIMIC数据资源
04-28
您已经成功下载了mimic-iii并填充了一个postgres数据库。 有关详细说明，请参见官方网站。 2.使用方法 以下步骤假定您正在空目录中工作。 mkdir ~ /mimicdump cd ~ /mimicdump 2.1-从数据库中提取文本文档 运行...
dicom数据集.zip
02-23
dicom数据集.zip
cxr:数据科学在胸部X射线研究中的最新技术探索
03-07
cxr 数据科学在胸部X射线研究中的最新技术探索 数据集 CheXpert：具有不确定性标签和专家比较的大型胸部X射线照片数据集 参考 我们可以信任深度学习模型... VinDr-CXR：带有放射线医生注释的胸部X射线开放数据集
MIMIC-IV文档介绍及使用笔记.docx
12-17
MIMIC-IV介绍文档，使用笔记 包括对各模块，表格及表格内字段的介绍，以及在使用中遇到的一些值得注意的问题 部分内容可见https://blog.csdn.net/weixin_46523923/article/details/121994699
MySQL数据库笔记（二）
2301_78671299的博客
06-18 1128
操作数据对象。接受参数返回一个结果。只对一行进行变换。每行返回一个结果。可以嵌套。参数可以是一列或一个值。聚合函数作用于一组数据，并对一组数据返回一个值。子查询指一个查询语句嵌套在另一个查询语句内部的查询。多表查询，也称为关联查询，指两个或更多个表一起完成查询操作。前提条件：这些一起查询的表之间是有关系的（一对一、一对多），它们之间一定是有关联字段，这个关联字段可能建立外键，也可能没有建立外键。比如：员工表和部门表，这两个表依靠“部门编号”进行关联。
如何在 MySQL 中创建和使用事务?
最新发布
lgbingyu00的博客
06-21 979
事务对于MySQL在业务生产系统中的作用非常重要，以上示例主要显示的数据的隔离性。当多条数据同时执行的时候，事务会保证业务执行同时成功或同时失败，这样使用有关联性的业务可以保持业务的一致性。
PostgreSQL源码分析——INSERT
让我思考一下
06-18 473
这里我们对INSERT语句进行分析， 只分析其宏观过程，具体细节后续再分析。我们就分析下面的语句的执行过程。
PostgreSQL源码分析——CREATE DATABASE
让我思考一下
06-18 751
这里我们分析一下在PostgreSQL中创建数据库的源码，在分析源码之前，最好先阅读《PostgreSQL指南内幕探索》的第一章，数据库集簇、数据库和数据表，弄清其空间布局，理解PG中，数据库、表、元组是怎么布局的。通俗一点说，创建一个数据库相当于创建一个数据目录，在这个目录下，存放该数据库中定义的表、索引等对象。
MySQL修改分隔符
2401_83963227的博客
06-18 268
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windows桌面运维----第七天
2401_83565544的博客
06-19 256
目录 1、运维有哪些方面选择： 2.网络速度慢： 3.无法访问某个网站： 4.无法共享文件或打印机： 5.无法连接VPN：
mimic-iv文档介绍及使用笔记
07-06
MIMIC-IV是一份医疗数据集，包含了大规模的多模态（诊断、手术、实验室检验结果等）的持续监测数据。该数据集是通过开放存取权限取得的，并且在假名化的情况下提供给研究人员使用。 MIMIC-IV数据集的目标是促进医疗研究的发展。它包含了来自美国波士顿市的波士顿儿童医院和波士顿岁丰医院的数据。这些数据可用于进行各种类型的研究，如疾病模型构建、机器学习算法的开发等。使用者可以通过提出请求并接受数据使用许可证来获取MIMIC-IV数据集。 在使用MIMIC-IV数据集时，需要注意一些保密和隐私方面的问题。由于数据含有患者的敏感信息，包括姓名、家庭住址等，因此使用者需要严格遵守数据使用规则。在进行研究时，应保持对患者个人隐私的尊重，并采取相应的安全措施确保数据不会被滥用或泄露。 此外，为了更好的利用MIMIC-IV数据集，使用者需要具备一定的医学和数据分析知识。因为该数据集提供了大量的多模态数据，正确解释和分析这些信息需要具备相关的领域知识。同时，对于数据的预处理和清洗也需要具备数据分析技巧。 总之，MIMIC-IV是一份丰富的医疗数据集，可以支持各种类型的研究。但是，在使用该数据集时，需要遵守相关的规则和保护患者隐私的原则，同时具备医学和数据分析的知识。通过正确使用MIMIC-IV数据集，研究人员可以为医疗领域的发展和人类健康做出更多的贡献。

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