linux操作（随着学习不断更新）

1.grep 查找关键字（可以带通配符） 文件名称
查看某个文件含有某个关键字的行信息
2.查看服务器cpu情况

cat /proc/cpuinfo | grep name | cut -f2 -d: | uniq -c

3.查看文件大小

du -sh 文件名

4.查看进程

ps

5.后台挂载

nohup 命令 &

6.解压tar.gz文件

tar -zxvf 压缩文件名.tar.gz

7.压缩成tar.gz文件

tar -zcvf 压缩文件名 .tar.gz 被压缩文件名

8.获取文件的第二列到指定文件

cat test.out | awk '{print $2}' >CDD.txt

9.去除文件相同的行，并放到指定文件里

cat CDD.txt | sort | uniq >CDDuniq.txt

10.截取以begin开头和end结尾的段落（sed)

sed -n '/^begin/,/^end/p' test01.txt

11.看linux版本

uname -a

12.统计文件中相同行的数量

`cat sorttest | sort | uniq -c`

13.linux获得文件相同的行

grep -wf 1.txt 2.txt

14.linux获得文件不同的行，那个文件在前，获得其中的文件

grep -wvf 1.txt 2.txt

15.linux获得多个DNA或RNA序列的长度

 awk '/^>/{if (l!="") print l; print; l=0; next}{l+=length($0)}END{print l}' protein-rdrp1.fasta>out.txt

16.linux获得fasta序列中序列的名称和长度、

conda install bioawk
bioawk -c fastx '{ print $name, length($seq) }' < 1.fasta