知识图谱系列三

Neo4j简介

图数据库是 NoSQL（非关系型数据库）的一种，它应用图形数据结构的特点（节点、属性和边）存储数据实体和相互之间的关系信息。

Neo4j 是当前较为主流和先进的原生图数据库之一，提供原生的图数据存储、检索和处理。支持ACID、集群、备份和故障转移，具有较高的可用性和稳定性；它具备非常好的直观性，通过图形化的界面表示节点和关系；同时它具备较高的可扩展性，能够承载上亿的节点、关系和属性，通过 REST 接口或者面向对象的 JAVA API进行访问。

基本概念

• 节点。对象实例，带有属性
• 关系。相当于图里的边，有向并带有属性
• 属性。key-value对

本文所用数据集介绍

39健康网。包括15项信息，其中7类实体，约3.7万实体，21万实体关系。

• 实体信息
  • diseases 疾病
  • aliases 别名
  • symptoms 症状
  • parts 部位
  • departments 科室
  • complications 并发症
  • drugs 药品
• 实体关系
  • disease_to_symptom 疾病与症状关系
  • disease_to_alias 疾病与别名关系
  • diseases_to_part 疾病与部位关系
  • disease_to_department 疾病与科室关系
  • disease_to_complication 疾病与并发症关系
  • disease_to_drug 疾病与药品关系

代码解读

主体类 MedicalGraph 介绍

class MedicalGraph:
    def __init__(self):
        pass    
    # 读取文件，获得实体，实体关系
    def read_file(self):
        pass
    # 创建节点
    def create_node(self, label, nodes):
        pass
    # 创建疾病节点的属性
    def create_diseases_nodes(self, disease_info):
        pass
    # 创建知识图谱实体
    def create_graphNodes(self):
        pass
    # 创建实体关系边
    def create_graphRels(self):
        pass
    # 创建实体关系边
    def create_relationship(self, start_node, end_node, edges, rel_type, rel_name):
        pass

运行结果图

在neo4j中，我们可以看到自己建立好的node和relationship

更多效果图如下：