LIDC-IDRI数据集linux服务器命令行下载command line方式

LIDC-IDRI肺结节公开数据集下载指南

LIDC-IDRI (The Lung Image Database Consortium)，该数据集由胸部医学图像文件(如CT、X光片)和对应的诊断结果病变标注组成。该数据是由美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)发起收集的，目的是为了研究高危人群早期癌症检测。
针对该数据集有大量任务可以研究，具体也可参考paperswithcode网站
数据集具体介绍可见其他博客，本文不再赘述。本文主要详写LIDC-IDRI数据集如何下载。

linux服务器下载

对于深度学习玩家，直接将数据集下载到服务器上是最方便的。但是网络上目前关于这方面的资料较少，故写下这篇文章帮助同样在探索的朋友们。

1. 数据集的下载链接为官网链接
   
   一般先需要下载红框里的NBIA Data Retriever才能下载数据。
2. 点进链接后，有详细的下载讲解，照官网一步一步安装即可。

由于照官网教程是需要sudo权限的，这里写一下非root账户如何下载（此处以ubuntu为例）
首先点击上图红框获得nbia-data-retriever-4.4.deb文件，上传至服务器后选好下载路径后执行dpkg -i nbia-data-retriever-4.4.deb
顺利安装后会生成一个opt文件夹，其中就有所需的nbia-data-retriever

3. NBIA Data Retriever安装好后，不要直接打开，先去获得manifest file（如果直接运行也会报错）。这个manifest file也就是下载清单，一个.tcia文件。该文件在官网链接可下载。
   下载完成后上传至服务器即可。
4. 此后安装照官网教程即可

对于没有linux桌面系统，通常采用命令行的小伙伴也不要着急。官网也贴心的准备了如何用命令行下载的教程Command-Line Interface Guide
教程非常详细，只不过很难发现，在此分享一下。
如果按上述顺利安装好NBIA Data Retriever后，执行

/opt/NBIADataRetriever/NBIADataRetriever --cli <location>/<manifest file name>.tcia -d <parent location>/<download directory>  -v –f

–cli 后为.tcia文件的路径
-d 后为数据集要下载到的地址

即可顺利开始数据集的下载。
数据集有大约125G，全部下载大约需要9小时。

windows下载

网络上关于windows的教程较多，此次贴几个链接。
教程1
教程2