fasta文件多行转为一行

假设fasta1如下：

>001
ATG
ATG
>001
AAC
AAT
>002
AAA
TTT

转换后的文件如下：

>001
ATGATG
>001
AACAAT
>002
AAATTT

方法1：

less fasta1 | tr '\n' '\t' | sed 's/\t>/\n>/g' |sed 's/\t/\n/' | sed 's/\t//g' | less

总结：
这个方法特别好，因为fasta1文件中存在两个001序列，一般的方法在对fasta1处理之后，会只保留单一的文件名，比如，两个001，在处理之后，只会保留一个

方法2：

less fasta1 | awk '/^>/&&NR>1{print "";}{printf "%s",/^>/?$0"\n":$0}' | less

总结：
这个方法也挺好，因为fasta1文件中存在两个001序列，一般的方法在对fasta1处理之后，会只保留单一的文件名，比如，两个001，在处理之后，只会保留一个

方法3：

less fasta1 | awk '{if($0~/>/) name=$0 ;else seq[name]=seq[name]$0;}END{for(i in seq) print i"\n"seq[i]}' | less

总结：
这个方法使用时要注意，因为fasta1文件中存在两个001序列，一般的方法在对fasta1处理之后，会只保留单一的文件名，比如，两个001，在处理之后，只会保留一个

另外：命令看不懂的地方可以参考链接中的详细解释
参考链接：https://blog.csdn.net/weixin_44022515/article/details/104257520