mega11进化树分析

已于 2023-03-02 18:53:04 修改
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分类专栏： mega11 nwk格式 文章标签： 学习
于 2023-03-02 17:03:36 首次发布
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版权

如何用mega11进行进化树分析

1.安装mega11

这个比较简单，我就不细说了

2.使用步骤

2.1：打开mega11后，如果你要做进化树分析，切记，右下角选择ANALYZE
注意
2.2
选择Edit 菜单下的Insert Sequence From File
**加粗样式
2.3
Creat a new alignment
在这里插入图片描述
2.4
根据实际情况选择DNA或者protein，这里我们选择protein
在这里插入图片描述
2.5
可以把一些对的不整齐的删除掉
在这里插入图片描述
2.6
序列比对，选择Ailgn by Clusta

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03-05 3046
特别提示：基于该方法软件提示输入需要是基因型 fa格式文件，故其它格式，如plink需要转换为 fa格式step1: 基于windows输出.mao文件----输出保存即可step2: 准备 fa 格式文件，进行进化树构建---生成 .nwk 文件step1: windows输入.fa文件选择nostep3: 可以直接看见进化树了----导出nwk文件导出NWK。
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