使用docker+orthanc搭建影像数据中心

概要

Orthanc是一款开源、轻量级的DICOM（数字成像和通信医学）服务器软件，它主要用于医疗保健和医疗研究领域。它支持多种类型的医学影像，包括但不限于CT（计算机断层扫描）、MRI（核磁共振成像）、X光、超声等。Orthanc能够接收、存储和传输DICOM格式的医学图像，这意味着它可以处理几乎所有类型的DICOM兼容影像。

DICOM（数字成像和通信医学）是一种广泛使用的医学影像文件格式，它支持多种影像模态，包括但不限于：

• CT（计算机断层扫描）：提供身体内部的横截面图像。
• MRI（核磁共振成像）：使用磁场和无线电波获取身体内部的详细图像。
• X光：传统的放射影像技术，用于检测骨骼和某些软组织问题。
• 超声：使用高频声波来创建身体内部的图像。
• PET（正电子发射断层扫描）：用于观察身体内的生物化学过程。
• SPECT（单光子发射计算机断层扫描）：用于评估血流和功能。

Orthanc还支持视频类型的DICOM文件，这包括2D+t（二维影像+时间）的动态影像，也被称作“cine”或电影式独立帧。

Orthanc特点

• 基于REST的架构：Orthanc采用RESTful API设计模式，允许通过标准的HTTP方法（如GET、POST等）与DICOM服务器进行交互。
• 跨平台：Orthanc支持多种操作系统，包括Windows和Linux，能够运行在多种硬件平台上。
• 不依赖外部数据库：Orthanc内置了SQLite数据库，不需要依赖外部数据库管理系统。
• 易于安装和配置：Orthanc提供了简单的安装过程和直观的Web界面，便于用户进行管理和操作。
• 支持多种DICOM操作：Orthanc支持多种DICOM命令，如C-ECHO、C-FIND、C-STORE、C-MOVE和C-GET等，用于测试连接、检索、传输和获取DICOM对象。
• Web服务：Orthanc内置了一个Web服务器，提供了一个用户友好的界面，允许用户通过浏览器访问和管理DICOM数据。
• 插件系统：Orthanc具有插件系统，可以通过安装插件来扩展其功能。 -
• Deconstructed PACS概念：Orthanc提出了“解构PACS”的概念，即通过组件化解决方案和基于标准的方法集成PACS的核心元素。
• 轻量级：Orthanc的架构轻量级，没有复杂的数据库管理，不依赖于第三方软件，易于维护和升级。。

Docker部署orthanc

使用Docker部署Orthanc是一种快速且方便的方式，下面是部署的基本步骤：

1. 拉取Docker镜像：
   Orthanc提供了官方的Docker镜像，你可以通过以下命令来拉取包含插件的Orthanc镜像：

   docker pull jodogne/orthanc-plugins
   

2. 创建数据持久化目录：
   为了确保Orthanc的数据在容器重启后依然存在，你需要在宿主机上创建一个目录，用于存放Orthanc的数据：

   mkdir  /data/orthanc/orthanc-db
   

3. 创建配置文件目录：
   为了方便修改配置， 创建配置文件目录

   mkdir /data/orthanc/config/
   

4. 配置文件导出：

   docker run --rm --entrypoint=cat jodogne/orthanc-plugins /etc/orthanc/orthanc.json > /data/orthanc/config/orthanc.json
   

   打开配置文件，在其中设置远程访问权限、启用用户认证，并注册新的用户和密码。

   {
         ......
         
   	  "RemoteAccessAllowed" : true,
         
         ......
   	  
   	  "AuthenticationEnabled" : true,
   	  "RegisteredUsers" : {
   	    "newUsername" : "newPassword"
   	  }
   	  ......
   }	
   

5. 运行Docker容器：
   使用以下命令启动Orthanc容器，并将宿主机的目录挂载到容器内部，以实现数据持久化：

   docker run --name orthanc -d --restart=always \
   -p 4242:4242 -p 8042:8042 \
   -v /data/orthanc/config/orthanc.json:/etc/orthanc/orthanc.json:ro  \
   -v /data/orthanc/orthanc-db:/var/lib/orthanc/db  \
   jodogne/orthanc-plugins
   

   这里-p 4242:4242和-p 8042:8042分别将容器的4242和8042端口映射到宿主机的相应端口，4242是DICOM服务端口，8042是Web界面访问端口。

6. 访问Orthanc Web界面：
   通过浏览器访问http://<宿主机IP>:8042，其中<宿主机IP>是运行Orthanc容器的宿主机IP地址。

7. 登录Orthanc：
   默认情况下，Orthanc的用户名和密码是配置文件中注册的用户名和密码。使用这些凭据登录Orthanc的Web界面。

8. 使用Orthanc：
   登录后，你可以使用Orthanc的Web界面上传DICOM影像，并通过REST API与DICOM viewer（例如OHIF）进行交互。

参考文章

1. 欢迎阅读《Orthanc之书》!
2. Docker版本Orthanc
3. 使用orthanc+ohlf搭建影像数据中心
4. DICOM文件下载
5. 什么是DICOM？如何获取？为何对病情诊断至关重要
6. Docker启动Orthanc
7. Orthanc在Windows下的基本使用和配置
8. openeuler（华为欧拉）/Centos搭建开源PACS系统Orthanc - DICOM（容器版）
9. 通过Orthanc了解DICOM