Python 计算累积分布函数CDF并绘图

累积分布函数定义

累积分布函数(cumulative distribution function, 缩写 CDF),定义如下:
F ( a ) = P ⁡ ( X ≤ a ) . F(a)=\operatorname{P}(X\le a). F(a)=P(Xa).
即累积分布函数表示:对离散变量而言,所有小于等于a的值出现概率的和。
(来源于百度百科

示例说明

用一个例子来理解累积分布函数:
比如对于一组数据:2, 3, 7, 6, 5, 0
先从小到大进行排序,变为:0, 2, 3, 5, 6, 7
数据的总长度为6
根据定义,对于第1个元素0,在[0, 2, 3, 5, 6, 7]中小于等于0的数有1个(即0,前1个),CDF值为1/6
同理,对于第2个元素2,在[0, 2, 3, 5, 6, 7]中小于等于2的数有2个(即0,2,前2个),CDF值为2/6
……
同理,对于第6个元素7,在[0, 2, 3, 5, 6, 7]中小于等于7的数有2个(即0,2,3,5,6,7,前6个),CDF值为6/6
因此,对于一组长度为length且已排好序的数据,第n个元素的CDF值为n/length

Python 代码实现

对于给定的一组数据data以及一个值a,对应的CDF值应该为找到所有小于等于a的数据个数再除以数据的总长度:

def cdf(data, a):
    length = len([i for i in data if i <= a])
    return length / (len(data))

接下来,计算data的累积分布函数
第一步,对data进行从小到大排序:

sorted_data = np.sort(data)

第二步,计算CDF,可以借助np.arange方法来计算,np.arange接受3个参数,分别为生成数据左边界值、右边界值(注意是左闭右开)、间隔(默认为1),表示生成从1len(data),间隔为1的一组等距序列,再除以数据的总长度,即生成从1/len(data)1的等距序列,即为CDF值:

cumulative_prob = np.arange(1, len(sorted_data) + 1, 1)/float(len(sorted_data))

第三步,绘图:

plt.plot(sorted_data, cumulative_prob)
plt.show()

完整的示例代码如下:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np


data = np.array([2, 3, 7, 6, 5, 0])
sorted_data = np.sort(data)
cumulative_prob = np.arange(1, len(sorted_data) + 1, 1)/float(len(sorted_data))
print(sorted_data)
print(cumulative_prob)

plt.plot(sorted_data, cumulative_prob)
plt.show()

控制台输出:

[0 2 3 5 6 7]
[0.16666667 0.33333333 0.5        0.66666667 0.83333333 1.        ]

绘图结果:
在这里插入图片描述

需要考虑相等数据吗?

我们并没有对包含相等数据的情况进行特殊考虑,比如0, 2, 2, 5, 6, 7这组数据中,前一个2得到的CDF值为0.33333333,后一个2得到的CDF值为0.5,显然0.5才是正确的,调用前文的cdf函数也将得到0.5的结果,但是绘图时后面的0.5会覆盖前一个0.33333333,因此绘制出来的图像仍然是正确的。

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