详情请点击下方:
孟德尔随机化的热度一直很高,不少想发文的对此肯定又爱又恨。今天我们看的这篇文章就仅用了双样本孟德尔随机化的方法,看似显而易见的关系,竟然结合了脂质组学,立马升华,发表一区(IF=10.1)!
2024年5月2日,中国学者做了一项双样本孟德尔随机化研究,在期刊《Haematologica》(医学一区top,IF=10.1)发表了题为:”Two-sample Mendelian randomization analysis reveals causal relationships between blood lipids and venous thromboembolism”的研究论文,旨在通过241个脂质相关性状作为暴露,并利用 FinnGen 联盟关于静脉血栓栓塞 (VTE)、深静脉血栓形成 (DVT)和肺栓塞 (PE)的数据作为结局,采用双样本孟德尔随机化(MR)分析来探究脂质与 VTE、DVT 和 PE 之间的因果关系。
本公众号回复“ 原文”即可获得文献PDF等资料 |
本研究数据来源GWAS,最终纳入241个脂质相关性状进行分析,研究过程如下图所示:
主要研究结果
1.与静脉血栓栓塞(VTE)相关的血脂以及血脂相关性状
在排除了14个表现出定向多效性或敏感性的暴露后,最终得出如下的结果:
-
1个磷脂酰胆碱(PC ae C40:4)和3个与中等低密度脂蛋白(LDL)相关性状对VTE有保护作用;
注:中等LDL相关性状为中等LDL中的总脂质、中等LDL颗粒浓度、中等LDL中的总胆固醇
-
2个与脂肪酸(FA)饱和度相关的性状显示出致病作用。
注:脂肪酸(FA)饱和度相关的性状为脂质中双烯丙基键与双键的比例、脂质中双烯丙基键与总脂肪酸的比率。
2.较高的脂肪酸(FA)不饱和度可能会增加静脉血栓栓塞(VTE)的风险
在去除14个不稳定暴露后,最终确定3个FA饱和度相关性状与DVT风险呈正相关。
这3个特征的MR-RAPS和加权中位数方法的结果也符合严格的显著性阈值(P值< 2.64×10−4)。加权模型和MR-Egger方法均显示与DVT有一定的因果关系(P值< 0.05)。遗传仪器的f统计量均大于10,表明不存在微弱的仪器偏差。
3.较高的脂肪酸(FA)不饱和度可能会增加肺栓塞(PE)的风险
经Bonferroni校正(P值< 2.64×10−4),研究结果如下:
-
2个磷脂酰胆碱(PC aa C42:6, PC ae C36:4)和2个FA饱和度相关的性状与PE呈正相关。
就在前几天,本公众号已经发过一篇类似的文章,同样是基于全基因组关联研究(GWAS)公开的汇总统计数据开展双向两样本孟德尔随机化分析,评估阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)与静脉血栓栓塞(VTE)(包括深静脉血栓形成(DVT)和肺栓塞(PE))之间的确切关联,阴性结果发了二区。
亏了亏了!双向孟德尔随机化阴性结果居然发了SCI二区(IF=6.7)
本文换了一个暴露,探究脂质与 VTE、DVT 和 PE 之间的因果关系,发了一区!难道又是一个宝藏指标吗?
本公众号回复“ 原文”即可获得文献PDF等资料 |
后记
无需原始数据,本文基于已有的遗传变异数据进行分析,无需额外的实验或收集原始数据,这大大减少了研究的时间和成本。
本文的研究思路非常清晰!
-
使用双样本孟德尔随机化(MR)方法分析脂质与静脉血栓栓塞之间存在的因果关系,包括逆方差加权(IVW)、稳健调整剖面评分(RAPS)、MR-egger、加权中位数和加权模式5种方法;
-
Cochran’s Q 和 Rucker’s Q 统计用于评估MR结果的多效性;
-
采用敏感性分析检测潜在显性SNP的存在。
孟德尔随机化在一区嘎嘎乱杀!要想发文就要不断找寻新的研究方向和切入点,抓住热点,大胆尝试!
如果你不知道从何入手,郑老师从入门到高级的孟德尔随机化课程你值得一看!!
详情请点击下方: