关键词：
Materials Studio，分子动力学模拟，均方位移，界面聚合
通过界面聚合制备纳滤膜的方法广泛应用与膜分离技术领域。该篇工作通过研究PIP单体在水中和PIP在PPTA水和中扩散的分子动力学模拟。首先构建了含PIP单体的水模拟盒子，在此基础上构建了PIP单体的PPTA-水凝胶模拟盒子，通过MSD曲线分析PPI纯水体系和PPI-水凝胶体系中迁移速率。
DOI: 10.1039/c9ta12984g
以下内容分步骤对文献模拟过程进行分析：
1、建立基础模型
构建PIP、PPTA、H2O分子模型，如图1所示。
图1 不同物质的分子结构模型
2、构建Amorphous cell模型
利用Materials Studio (MS)中的Amorphous cell模块，在COMMPASSII力场条件下构建两个模型：（1）模型包含10个PIP分子和320个水分子；（2）10个PIP分子、40个TBP分子、1个含2重复单元PPTA。
（a） （b）
图1 两个模型（a：PPI）（b：PPI-PPTA）
（a）（b）（c）
图2 两个模型的AC参数（a：PPI）（b：PPI-PPTA）（c：模型参数）
2、模型结构优化
使用Forcite 模块对上述混合有机相模型分别进行结构优化，使其达到最佳的模型结构和稳定的能量体系。模型参数如图3所示。收敛和能量数据如图5所示。
图3两个模型的Forcite 模型参数
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（a）
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（b）
图4 模型的收敛以及能量数据（a：PPI）（b：PPI-PPTA）
3、动力学优化
对上述结构优化后的模型继续进行动力学优化。
1. NVT模式下100ps。动力学参数如图5所示，动力学计算结果如图6所示。
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图5 动力学优化参数
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（a）
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图6 计算平衡后的能量和温度数据（a：PPI）（b：PPI-PPTA）
2.NPT模式下100ps，动力学参数如图7所示，动力学计算结果如图8所示。
图7 动力学优化参数
（a）
图8 计算平衡后的能量和密度数据（a：PPI）（b：PPI-PPTA）
3. NVT模式下100ps。动力学参数如图9所示，动力学计算结果如图10所示。
图9 动力学优化参数
（a）
（b）
图10 计算平衡后的能量和温度数据（a：PPI）（b：PPI-PPTA）
4、均方位移（MSD）计算
对上述优化后的模型进行MSD计算。模型及设置面板如下图11所示。结果数据如图12所示。
（a）
（b）
图8 优化后模型及MSD参数（a：PPI）（b：PPI-PPTA（PPI-2））
图9 MSD结果（a：PPI）（b：PPI-PPTA（PPI-2））
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