利用python进行数据分析 第九章 绘图和可视化

信息可视化（也叫绘图）是数据分析中最重要的工作之一。它可能是探索过程的一部分，例如，帮

助我们找出异常值、必要的数据转换、得出有关模型的idea等。另外，做一个可交互的数据可视化

也许是工作的最终目标。Python有许多库进行静态或动态的数据可视化，但我这里重要关注于

matplotlib（ http://matplotlib.org/）和基于它的库。

matplotlib是一个用于创建出版质量图表的桌面绘图包（主要是2D方面）。该项目是由John Hunter

于2002年启动的，其目的是为Python构建一个MATLAB式的绘图接口。matplotlib和IPython社区进

行合作，简化了从IPython shell（包括现在的Jupyter notebook）进行交互式绘图。matplotlib支持

各种操作系统上许多不同的GUI后端，而且还能将图片导出为各种常见的矢量（vector）和光栅

（raster）图：PDF、SVG、JPG、PNG、BMP、GIF等。除了几张，本书中的大部分图都是用它

生成的。

随着时间的发展，matplotlib衍生出了多个数据可视化的工具集，它们使用matplotlib作为底层。其

中之一是seaborn（ http://seaborn.pydata.org/），本章后面会学习它。

学习本章代码案例的最简单方法是在Jupyter notebook进行交互式绘图。在Jupyter notebook中执

行下面的语句：

%matplotlib notebook

9.1 matplotlib API入门

matplotlib的通常引入约定是：

In [11]: import matplotlib.pyplot as plt

在Jupyter中运行%matplotlib notebook（或在IPython中运行%matplotlib），就可以创建一个简单

的图形。如果一切设置正确，会看到图9-1：

In [12]: import numpy as np
In [13]: data = np.arange(10)
In [14]: data
Out[14]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])
In [15]: plt.plot(data)

虽然seaborn这样的库和pandas的内置绘图函数能够处理许多普通的绘图任务，但如果需要自定义

一些高级功能的话就必须学习matplotlib API。

笔记：虽然本书没有详细地讨论matplotlib的各种功能，但足以将你引入门。matplotlib的示例

库和文档是学习高级特性的最好资源。

Figure和Subplot

matplotlib的图像都位于Figure对象中。你可以用plt.figure创建一个新的Figure：

In [16]: fig = plt.figure()

如果用的是IPython，这时会弹出一个空窗口，但在Jupyter中，必须再输入更多命令才能看到。

plt.figure有一些选项，特别是figsize，它用于确保当图片保存到磁盘时具有一定的大小和纵横比。

不能通过空Figure绘图。必须用add_subplot创建一个或多个subplot才行：

In [17]: ax1 = fig.add_subplot(2, 2, 1)

这条代码的意思是：图像应该是2×2的（即最多4张图），且当前选中的是4个subplot中的第一个

（编号从1开始）。如果再把后面两个subplot也创建出来，最终得到的图像如图9-2所示：

In [18]: ax2 = fig.add_subplot(2, 2, 2)
In [19]: ax3 = fig.add_subplot(2, 2, 3)

ᨀ示：使用Jupyter notebook有一点不同，即每个小窗重新执行后，图形会被重置。因此，

对于复杂的图形，，你必须将所有的绘图命令存在一个小窗里。

这里，我们运行同一个小窗里的所有命令：

fig = plt.figure()
ax1 = fig.add_subplot(2, 2, 1)
ax2 = fig.add_subplot(2, 2, 2)
ax3 = fig.add_subplot(2, 2, 3)

如果这时执行一条绘图命令（如plt.plot([1.5, 3.5, -2, 1.6])），matplotlib就会在最后一个用过的

subplot（如果没有则创建一个）上进行绘制，隐藏创建figure和subplot的过程。因此，如果我们执

行下列命令，你就会得到如图9-3所示的结果：

In [20]: plt.plot(np.random.randn(50).cumsum(), 'k--')

"k--"是一个线型选项，用于告诉matplotlib绘制黑色虚线图。上面那些由fig.add_subplot所返回的对象是AxesSubplot对象，直接调用它们的实例方法就可以在其它空着的格子里面画图了，如图9-4

所示：

In [21]: ax1.hist(np.random.randn(100), bins=20, color='k', alpha=0.3)
In [22]: ax2.scatter(np.arange(30), np.arange(30) + 3 * np.random.randn(30))

你可以在matplotlib的文档中找到各种图表类型。

创建包含subplot网格的figure是一个非常常见的任务，matplotlib有一个更为方便的方法

plt.subplots，它可以创建一个新的Figure，并返回一个含有已创建的subplot对象的NumPy数组：

In [24]: fig, axes = plt.subplots(2, 3)
In [25]: axes
Out[25]:
array([[<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x7fb626374048>,
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x7fb62625db00>,
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x7fb6262f6c88>],
[<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x7fb6261a36a0>,
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x7fb626181860>,
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x7fb6260fd4e0>]], dtype
=object)

这是非常实用的，因为可以轻松地对axes数组进行索引，就好像是一个二维数组一样，例如

axes[0,1]。你还可以通过sharex和sharey指定subplot应该具有相同的X轴或Y轴。在比较相同范围

的数据时，这也是非常实用的，否则，matplotlib会自动缩放各图表的界限。有关该方法的更多信

息，请参见表9-1。

调整subplot周围的间距

默认情况下，matplotlib会在subplot外围留下一定的边距，并在subplot之间留下一定的间距。间距

跟图像的高度和宽度有关，因此，如果你调整了图像大小（不管是编程还是手工），间距也会自动

调整。利用Figure的subplots_adjust方法可以轻而易举地修改间距，此外，它也是个顶级函数：

subplots_adjust(left= None , bottom= None , right= None , top= None ,

wspace= None , hspace= None )

wspace和hspace用于控制宽度和高度的百分比，可以用作subplot之间的间距。下面是一个简单的

例子，其中我将间距收缩到了0（如图9-5所示）：

fig, axes = plt.subplots(2, 2, sharex=True, sharey=True)
for i in range(2):
for j in range(2):
axes[i, j].hist(np.random.randn(500), bins=50, color='k', alpha=0.5)
plt.subplots_adjust(wspace=0, hspace=0)

不难看出，其中的轴标签重叠了。matplotlib不会检查标签是否重叠，所以对于这种情况，你只能

自己设定刻度位置和刻度标签。后面几节将会详细介绍该内容。

颜色、标记和线型

matplotlib的plot函数接受一组X和Y坐标，还可以接受一个表示颜色和线型的字符串缩写。例如，

要根据x和y绘制绿色虚线，你可以执行如下代码：

ax.plot(x, y, 'g--')

这种在一个字符串中指定颜色和线型的方式非常方便。在实际中，如果你是用代码绘图，你可能不

想通过处理字符串来获得想要的格式。通过下面这种更为明确的方式也能得到同样的效果：

ax.plot(x, y, linestyle='--', color='g')

常用的颜色可以使用颜色缩写，你也可以指定颜色码（例如，'#CECECE'）。你可以通过查看plot

的文档字符串查看所有线型的合集（在IPython和Jupyter中使用plot?）。

线图可以使用标记强调数据点。因为matplotlib可以创建连续线图，在点之间进行插值，因此有时

可能不太容易看出真实数据点的位置。标记也可以放到格式字符串中，但标记类型和线型必须放在

颜色后面（见图9-6）：

In [30]: from numpy.random import randn
In [31]: plt.plot(randn(30).cumsum(), 'ko--')

还可以将其写成更为明确的形式：

plot(randn(30).cumsum(), color='k', linestyle='dashed', marker='o')

在线型图中，非实际数据点默认是按线性方式插值的。可以通过drawstyle选项修改（见图9-7）：

In [33]: data = np.random.randn(30).cumsum()
In [34]: plt.plot(data, 'k--', label='Default')
Out[34]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x7fb624d86160>]
In [35]: plt.plot(data, 'k-', drawstyle='steps-post', label='steps-post')
Out[35]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x7fb624d869e8>]
In [36]: plt.legend(loc='best')

你可能注意到运行上面代码时有输出。matplotlib会返回引用了新添加的子组件的对象。大多数时

候，你可以放心地忽略这些输出。这里，因为我们传递了label参数到plot，我们可以创建一个plot

图例，指明每条使用plt.legend的线。

笔记：你必须调用plt.legend（或使用ax.legend，如果引用了轴的话）来创建图例，无论你

绘图时是否传递label标签选项。

刻度、标签和图例

对于大多数的图表装饰项，其主要实现方式有二：使用过程型的pyplot接口（例如，

matplotlib.pyplot）以及更为面向对象的原生matplotlib API。

pyplot接口的设计目的就是交互式使用，含有诸如xlim、xticks和xticklabels之类的方法。它们分别

控制图表的范围、刻度位置、刻度标签等。其使用方式有以下两种：

调用时不带参数，则返回当前的参数值（例如，plt.xlim()返回当前的X轴绘图范围）。

调用时带参数，则设置参数值（例如，plt.xlim([0,10])会将X轴的范围设置为0到10）。

所有这些方法都是对当前或最近创建的AxesSubplot起作用的。它们各自对应subplot对象上的两个

方法，以xlim为例，就是ax.get_xlim和ax.set_xlim。我更喜欢使用subplot的实例方法（因为我喜

欢明确的事情，而且在处理多个subplot时这样也更清楚一些）。当然你完全可以选择自己觉得方

便的那个。

设置标题、轴标签、刻度以及刻度标签

为了说明自定义轴，我将创建一个简单的图像并绘制一段随机漫步（如图9-8所示）：

In [37]: fig = plt.figure()
In [38]: ax = fig.add_subplot(1, 1, 1)
In [39]: ax.plot(np.random.randn(1000).cumsum())

要改变x轴刻度，最简单的办法是使用set_xticks和set_xticklabels。前者告诉matplotlib要将刻度放

在数据范围中的哪些位置，默认情况下，这些位置也就是刻度标签。但我们可以通过

set_xticklabels将任何其他的值用作标签：

In [40]: ticks = ax.set_xticks([0, 250, 500, 750, 1000])
In [41]: labels = ax.set_xticklabels(['one', 'two', 'three', 'four', 'five'],
....: rotation=30, fontsize='small')

rotation选项设定x刻度标签倾斜30度。最后，再用set_xlabel为X轴设置一个名称，并用set_title设

置一个标题（见图9-9的结果）：

In [42]: ax.set_title('My first matplotlib plot')
Out[42]: <matplotlib.text.Text at 0x7fb624d055f8>
In [43]: ax.set_xlabel('Stages')

Y轴的修改方式与此类似，只需将上述代码中的x替换为y即可。轴的类有集合方法，可以批量设定

绘图选项。前面的例子，也可以写为：

props = {
'title': 'My first matplotlib plot',
'xlabel': 'Stages'
}
ax.set(**props)

添加图例

图例（legend）是另一种用于标识图表元素的重要工具。添加图例的方式有多种。最简单的是在

添加subplot的时候传入label参数：

In [44]: from numpy.random import randn
In [45]: fig = plt.figure(); ax = fig.add_subplot(1, 1, 1)
In [46]: ax.plot(randn(1000).cumsum(), 'k', label='one')
Out[46]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x7fb624bdf860>]
In [47]: ax.plot(randn(1000).cumsum(), 'k--', label='two')
Out[47]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x7fb624be90f0>]
In [48]: ax.plot(randn(1000).cumsum(), 'k.', label='three')
Out[48]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x7fb624be9160>]

在此之后，你可以调用ax.legend()或plt.legend()来自动创建图例（结果见图9-10）：

In [49]: ax.legend(loc='best')

legend方法有几个其它的loc位置参数选项。请查看文档字符串（使用ax.legend?）。

loc告诉matplotlib要将图例放在哪。如果你不是吹毛求疵的话，"best"是不错的选择，因为它会选

择最不碍事的位置。要从图例中去除一个或多个元素，不传入label或传入label=' nolegend '即可。

（中文第一版这里把best错写成了beat）

注解以及在Subplot上绘图

除标准的绘图类型，你可能还希望绘制一些子集的注解，可能是文本、箭头或其他图形等。注解和

文字可以通过text、arrow和annotate函数进行添加。text可以将文本绘制在图表的指定坐标(x,y)，

还可以加上一些自定义格式：

ax.text(x, y, 'Hello world!',
family='monospace', fontsize=10)

注解中可以既含有文本也含有箭头。例如，我们根据最近的标准普尔500指数价格（来自

Yahoo!Finance）绘制一张曲线图，并标出2008年到2009年金融危机期间的一些重要日期。你可

以在Jupyter notebook的一个小窗中试验这段代码（图9-11是结果）：

from datetime import datetime
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1, 1, 1)
data = pd.read_csv('examples/spx.csv', index_col=0, parse_dates=True)
spx = data['SPX']
spx.plot(ax=ax, style='k-')
crisis_data = [
(datetime(2007, 10, 11), 'Peak of bull market'),
(datetime(2008, 3, 12), 'Bear Stearns Fails'),
(datetime(2008, 9, 15), 'Lehman Bankruptcy')
]
for date, label in crisis_data:
ax.annotate(label, xy=(date, spx.asof(date) + 75),
xytext=(date, spx.asof(date) + 225),
arrowprops=dict(facecolor='black', headwidth=4, width=2,
headlength=4),
horizontalalignment='left', verticalalignment='top')
# Zoom in on 2007-2010
ax.set_xlim(['1/1/2007', '1/1/2011'])
ax.set_ylim([600, 1800])
ax.set_title('Important dates in the 2008-2009 financial crisis')

这张图中有几个重要的点要强调：ax.annotate方法可以在指定的x和y坐标轴绘制标签。我们使用

set_xlim和set_ylim人工设定起始和结束边界，而不使用matplotlib的默认方法。最后，用

ax.set_title添加图标标题。

更多有关注解的示例，请访问matplotlib的在线示例库。

图形的绘制要麻烦一些。matplotlib有一些表示常见图形的对象。这些对象被称为块（patch）。其

中有些（如Rectangle和Circle），可以在matplotlib.pyplot中找到，但完整集合位于

matplotlib.patches。

要在图表中添加一个图形，你需要创建一个块对象shp，然后通过ax.add_patch(shp)将其添加到

subplot中（如图9-12所示）：

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1, 1, 1)
rect = plt.Rectangle((0.2, 0.75), 0.4, 0.15, color='k', alpha=0.3)
circ = plt.Circle((0.7, 0.2), 0.15, color='b', alpha=0.3)
pgon = plt.Polygon([[0.15, 0.15], [0.35, 0.4], [0.2, 0.6]],
color='g', alpha=0.5)
ax.add_patch(rect)
ax.add_patch(circ)
ax.add_patch(pgon)

如果查看许多常见图表对象的具体实现代码，你就会发现它们其实就是由块patch组装而成的。

将图表保存到文件

利用plt.savefig可以将当前图表保存到文件。该方法相当于Figure对象的实例方法savefig。例如，

要将图表保存为SVG文件，你只需输入：

plt.savefig('figpath.svg')

文件类型是通过文件扩展名推断出来的。因此，如果你使用的是.pdf，就会得到一个PDF文件。我

在发布图片时最常用到两个重要的选项是dpi（控制“每英寸点数”分辨率）和bbox_inches（可以剪

除当前图表周围的空白部分）。要得到一张带有最小白边且分辨率为400DPI的PNG图片，你可

以：

plt.savefig('figpath.png', dpi=400, bbox_inches='tight')
savefig并非一定要写入磁盘，也可以写入任何文件型的对象，比如BytesIO：
from io import BytesIO
buffer = BytesIO()
plt.savefig(buffer)
plot_data = buffer.getvalue()

表9-2列出了savefig的其它选项。

matplotlib配置

matplotlib自带一些配色方案，以及为生成出版质量的图片而设定的默认配置信息。幸运的是，几

乎所有默认行为都能通过一组全局参数进行自定义，它们可以管理图像大小、subplot边距、配色

方案、字体大小、网格类型等。一种Python编程方式配置系统的方法是使用rc方法。例如，要将全

局的图像默认大小设置为10×10，你可以执行：

plt.rc('figure', figsize=(10, 10))

rc的第一个参数是希望自定义的对象，如'figure'、'axes'、'xtick'、'ytick'、'grid'、'legend'等。其后

可以跟上一系列的关键字参数。一个简单的办法是将这些选项写成一个字典：

font_options = {'family' : 'monospace',
'weight' : 'bold',
'size' : 'small'}
plt.rc('font', **font_options)

要了解全部的自定义选项，请查阅matplotlib的配置文件matplotlibrc（位于matplotlib/mpl-data目录

中）。如果对该文件进行了自定义，并将其放在你自己的.matplotlibrc目录中，则每次使用

matplotlib时就会加载该文件。

下一节，我们会看到，seaborn包有若干内置的绘图主题或类型，它们使用了matplotlib的内部配

置。