科研绘图（Matplotlib.pyplot）

        本文为目标导向，目标就是利用Matplotlib绘制类似于下图的多子图、图例位于坐标轴外且格式为矢量图的论文插图。

利用Matplotlib库绘图的推荐路线：

首先根据需求搜索所需函数；

之后直接根据函数名搜索官方网站的函数解释，英文原文的解释非常全面，也不会造成误解，中文文章都是二次加工，且不够全面，很容易造成使用时的偏差。

一、明确几个概念：

首先import matplotlib.pyplot as plt

例如使用命令figure, ax = plt.subplots(2, 2)，其中：

命令中所得到的figure为画布，一个画布上可以有多张子图

所得到的ax为子图

2, 2表示行和列上分别有几个子图（axes）

 上图来源于【Python基础】Matplotlib如何绘制多个子图的几种方法_风度78的博客-CSDN博客

二、绘图流程

        该图片出处为matplotlib.pyplot的使用总结大全（入门加进阶） - 知乎

三、plt和ax的区别

        首先明确，plt是在import matplotlib.pyplot as plt时为pyplot创建的别名；ax是在figure, ax = plt.subplots(2, 2)时为subplots函数所返回的axes对象创建的别名。借用一、里面的图，plt其实是对整个画布对象进行操作，而ax实际上是对子图对象进行操作。因此如果要绘制有多子图的图片，更建议使用ax来进行绘图，因为更加灵活。

四、绘图

1、设置整体框架，添加所需元素

（1）创建画布、设置画布名称

fig = plt.figure()  # 1、创建画布对象并添加画布名称
fig.suptitle('P-R Curve')

（2）多子图的创建、选取

        核心点在于选定好子图的对应位置，之后就可利用plot方法画折线图、scatter方法画散点图、pie方法画饼图、bar方法画条形图等。

        选定子图对应位置的方法有以下三种：

1、如一中提到的，利用figure, axes = plt.subplots(2, 2)命令，之后axes即为一个保存了四个子图的变量，利用axes[0][0]访问左上子图、axes[0][1]访问右上子图、axes[1][0]访问左下子图、axes[1][1]访问右下子图；

2、利用figure的add_subplot方法来选定子图。此种方法首先要用figure=plt.figure()创建画布对象；之后用所创建的画布对象的内置方法add_subplot得到子图的实例对象，如ax1=fig.add_subplot(221)代表ax1是为2*2画布上左上角的子图对象，之后利用ax1.plot()等方法进行绘图；

3、直接利用plt.subplot选定画布上的子图位置，用法为plt.subplot(221)，221表示2*2画布上的第一个子图也就是左上子图，之后直接plt.plot()等方法绘图即可。

        一些具体的多子图代码实现或不规则子图的绘制可参考【Python基础】Matplotlib如何绘制多个子图的几种方法_风度78的博客-CSDN博客

2、设置图中各元素的所需属性

可以通过创建后缀为.mplstyle的自定义风格文件利用rcParams来设置各元素的属性，具体见Customizing Matplotlib with style sheets and rcParams — Matplotlib 3.7.1 documentation

需要哪些属性可以在上述链接的官方默认配置文档中查找

3、主标题和子标题的设定

        设置主标题：使用画布对象并调用其suptitle()函数

        设置子标题：使用子图对象并调用其set_title()函数

4、设置坐标轴标签

        若绘制只有一个子图的图片，可以直接使用plt.xlabel或plt.ylabel进行坐标轴标签的设置

        若绘制多子图图片，在选定了子图对象之后，调用其set_xlabel或set_ylabel函数即可设置其坐标轴标签

5、图例位置的设置

可以参考matplotlib.pyplot.axes和add_axes这两个函数

6、保存图像

命令：plt.savefig(保存的文件名，dpi值)，其中dpi代表the resolution in dots per inch（每英寸点的分辨率），通常普通图片dpi值设置为300，折线图设置为600（最好1000），参考链接【7】python_matplotlib 输出(保存)矢量图方法；画图时图例说明(legend)放到图像外侧；Python_matplotlib图例放在外侧保存时显示不完整问题解决 - ✨汀、 - 博客园

如果保存tiff格式的时候图片文件太大，可以在savefig函数里添加参数

pil_kwargs={"compression": "tiff_lzw"}

该压缩方法参考matplotlib保存tif图像时压缩_铜锣烧阿南Anan的博客-CSDN博客

PS：savefig命令要放到plt.show()命令之前，否则将保存空白图

7、科研图常用配色

参考Matplotlib颜色设置_半月夏微凉的博客-CSDN博客

我的常用配色

color_set = ['turquoise', 'lightpink', 'gold', 'tomato', 'limegreen', 'xkcd:lilac', 'royalblue', 'brown', 'red']

8、解决Linux下matplotlib找不到times new roman 或 simhei字体的问题

结合以下两个链接可以解决

Matplotlib找不到Times New Roman的解决方案 - 知乎

解决使用matplotlib.pyplot画图包含中文乱码显示问题（macbook上 family ‘sans-serif‘ not found 问题）_pyplot中文乱码_zzzxydq的博客-CSDN博客