DEEPIN系统安装各个版本的R语言

官方版本只有3.5.3太低了,很多生物信息的包都至少3.6所以我花大概快一个星期终于找到了办法,按道理应该很简单的事情被我复杂了

安装老是遇到问题不过好在安装成功了

在这里插入图片描述

获取库源

https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/bin/linux/debian/#supported-branches
对应的安装版本有相应的库源,所以为了自动化安装我们就要找到相应的库源

vim /etc/apt/sources.list#存放库源的文件,在里面加入相应R的库源

库源就是下面那个划圈的
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
加入后,更新库更新库要在root模式下

su
apt update
apt upgrade

在这一步可能会出现没有公共密钥的情况,
在这里插入图片描述
NO——PUBKEY后面的就是密钥,将密钥加入密钥库

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys FCAE2A0E115C3D8A#FCAE2A0E115C3D8A这是密钥你换成你的就是

安装R

apt install -t buster-cran40 r-base

不要直接安装使用apt install r-base这样安装最后还是3.5.3,使用库安装,你加入的库后面有个库名,库名在加r-base这样就可以安装成功了,不然会出现没有依赖包的情况
在这里插入图片描述
//官网有详细安装思路,可以看那个找库的网址,有安装方案。//

安装完成R后最考虑的就是rJava的安装

这里就要考虑到jdk了,现在jdk官网找到一个版本合适的jdk

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