Dpabi数据预处理（无T1结构图像）

Tips：对fMRI功能图像和结构图像预处理的可参考另外一篇博主的文章，很详细。点击跳转
但是对于我所要分析研究的fMRI数据没有结构像，所以那篇文章对于我来说也是一个学习和参考，也是摸索了好久才有点头绪，希望自己的一点经验能帮到大家。

一、准备工作

1. 安装Dpabi。（注意在设置路径中选择【添加并包含子文件夹】，否则会出现无法正常启动Dpabi的情况）
   

2. 在Matlab命令窗口输入【dpabi】启动，选择【DPARSF X.X】
   

3. 然后选择【DPARSF Basic Edition】
   这个能对功能图像进行处理，不需要结构图像。据说Advanced这个也能处理无结构图像的fMRI数据，但是我不会…
   

4. 进入界面
   

5. 数据集准备。可以从官网找数据练手，也能用自己的数据。（注意将每个被试放在FunImg文件夹中）
   

二、勾选预处理项目

1. 选择FunImg上一级目录，也就是Test2
   
2. 输入数据的Time Points 和 TR
   Time Point可以用MRIcron软件来查看
   
3. 判断自己的fMRI数据是DICOM格式还是NII格式
   DICOM格式则勾上，NII格式则不勾。
   
4. 更改文件名。改成装被试文件的文件名，在本文的数据集中就是FunImg。
   

做完上述四步后【回车】，会自动读取出FunImg文件夹下的被试信息。没有出现的好好检查一下自己的数据集结构，对照上述步骤看看哪里出错了。

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然后就是一般的预处理步骤了

1. 去除前10个时间点
   

2. 时间层矫正
   
   这里要注意一下，每个fMRI数据的层数是不一样的。大家可以用MRIcron看一下。
   例如本文的nii文件：
   
   
   图中的【K Space】对应的数字就是层数
   所以，本文的nii文件是91层。设置参数应该为：
   Slice Numer：91
   Slice Order：[1:2:91,2:2:90]
   Reference Slice：91
   【如果还不清楚，可以参考文章开头提到的那位博主的说明，更清晰一些。】

3. 头动矫正、归一标准化、滤波等等。后面基本上不需要再点什么了。
   
   需要注意的是Normalize by using中，因为没有结构像，所以要选择EPI templates，不要选错了。

4. 功能连接，提取ROI。需要点击【Define ROI】,选择需要的模板。
   

5. 基本操作结束了，点击【RUN】。
   

三、查看结果

回到Matlab中命令行窗口查看运行结果。
如果一切顺利的话，文件目录应该会是这个样子：

出现以下文件后缀的文件夹，说明你操作成功了。

最后，希望大家一次成功！