一些使用DPABI处理fMRI数据的记录

最新推荐文章于 2024-04-12 17:02:39 发布
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分类专栏： DPRABI 文章标签： matlab
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一些使用DPABI处理fMRI数据的记录

在对fMRI数据进行预处理时遇到不少问题，记录一下，方便以后参考

文件排列问题

开始处理时会出现“未找到匹配的文件”的问题

在这里插入图片描述

文件需要严格按照官网中（http://rfmri.org/DemoData）DemoData文件夹排列

在这里插入图片描述

矩阵索引超出问题

在这里插入图片描述

在试着处理AD的数据时，出现有个病人的文件中只有196个DCM文件，而time points我们设置为197，遂出现上述问题，处理的数据中似乎所有病人的DCM文件数量需要一致。

参数配置问题

使用默认参数时，去除前面10个时间节点报错，通过查阅学长的笔记，发现是slice number和time points的问题，将其分别改为48和197，问题得到解决。

处理结果

在这里插入图片描述
其中
1.A表示时间层校正
2.R表示头动校正
3.W表示标准化
4.S表示平滑
5.D表示去线性漂移（这里没有去除线性漂移）
6.F表示滤波
7.C表示去除无关变量

下饭绿洲
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如何在matlab中使用dpabi处理数据?
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在Matlab中使用DPABI（Data Processing & Analysis for Brain Imaging）处理数据，需要依次进行以下步骤： 1. 安装DPABI软件包：首先，需要从DPABI官方网站上下载最新版本的DPABI。然后将下载的文件解压缩到本地目录中。 2. 设置Matlab路径：打开Matlab，将DPABI解压后的文件夹添加到Matlab的工作路径中。点击“Home”按钮，在右侧的“Environment”部分点击“Set Path”按钮，然后点击“Add with Subfolders”，选择DPABI解压后的文件夹。 3. 运行DPABI：在Matlab命令窗口中输入“DPABI”命令，并按回车键运行。这样就会启动DPABI的主界面。 4. 选择数据：在DPABI主界面中，点击左上方的“Data”按钮，弹出数据选择对话框。在对话框中选择要处理的数据文件，如fMRI图像数据。 5. 设定处理参数：在DPABI主界面中，点击右上方的“Data Processing”按钮，弹出处理参数设置对话框。在对话框中可以设定一些处理参数，如滤波器频率和截断值等。 6. 开始处理：设定好处理参数后，点击对话框中的“Run”按钮，开始进行数据处理。DPABI会自动运行相应的预处理步骤，如头动补偿、切片时间校正、空间标准化等。 7. 查看结果：处理完成后，可以在DPABI主界面的右下方查看处理结果。点击相应的结果按钮，如“ReHo”、“ALFF”、“fALFF”等，可以显示对应的图像结果和统计信息。 8. 保存结果：若需要保存处理结果，可以点击结果窗口中的“Save”按钮，选择保存的路径和文件名，将结果保存为mat文件或NIfTI格式的图像。 总之，要在Matlab中使用DPABI处理数据，首先需要安装DPABI软件包并将其添加到Matlab的工作路径中，然后运行DPABI主界面，选择数据并设定处理参数，点击运行按钮开始处理，最后查看结果并保存。

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