密度峰值算法介绍及python实现

最新推荐文章于 2024-09-15 22:31:42 发布
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分类专栏： # 聚类 文章标签： python 算法 聚类
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1.先看一个案例

以经典 iris 数据为例，经典数据集 iris 内包含 3 类共 150 条记录，每类各 50 个数据，每条记录都有 4 项特征：花萼长度、花萼宽度、花瓣长度、花瓣宽度，可以通过这 4 个特征预测鸢尾花卉属于(iris-setosa, iris-versicolour, iris-virginica) 中的哪一品种。

初始条件设置：

考虑到已知真实分类为 3 类，初始设置超参数：簇类数量 K=3；

DBSCAN 密度聚类半径设为 0.5，高密度阈值设为 2。

以下为 python 代码：

参考文献
[1] 密度峰值聚类算法总结及其python实现_Clustering聚类算法总结+python实践 2020.12

赵孝正
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专栏目录
【数据聚类】第四章第三节：密度峰值聚类及其Python实现
快乐江湖的博客
07-13 1653
Python代码关于簇的定义尚未达成共识，每种算法有各自的定义重点讲了K-Means这类算法的缺点 图1A展示的是二维空间中28个点，肉眼可见密度最大的便是1号点和10号点图1B展示的是这28个点的pip_{i}pi​和σi\sigma_{i}σi​之间关系本算法中这两张图称之为决策图从图1B中可以看出，9号点和10号点ppp值相同但σ\sigmaσ不同：9号点处在1号点的簇中，其他有着高密度的点和其十分接近，然而10号点虽然和9号点密度相仿，但最近的高密度却属于其他簇（距离）像点27、27、28由于ppp
密度聚类(Density peaks Clustering)Python实现
10-07
Rodriguez A, Laio A. Clustering by fast search and find of density peaks[J]. Science, 2014, 344(6191): 1492-1496.基于这篇文章实现的最基本的密度聚类的算法，具体请看我博客中的相关文章http://blog.csdn.net/kryolith/article/details/39832573
密度峰值聚类算法DPC(Density Peak Clustering)理论基础与python实现
褪色的博客
04-06 8981
基于密度峰值的聚类算法全称为基于快速搜索和发现密度峰值的聚类算法(clustering by fast search and find of density peaks, DPC)。它是2014年在Science上提出的聚类算法，该算法能够自动地发现簇中心，实现任意形状数据的高效聚类。密度峰值聚类算法是对K-Means算法的一种改进，是一种不需要迭代的，可以一次性找到聚类中心的方法聚类方法。
Python：密度峰值聚类DPCA，分裂两簇（版本：1）
DeniuHe的博客
11-15 848
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn import datasets from scipy.spatial.distance import pdist,squareform def getDistCut(distList,distPercent): maxDist = max(distList) ...
密度峰值聚类(DPC)算法（Python3实现）
helloWorld的博客
04-27 2827
密度峰值聚类（Density peaks clustering, DPC）算法是由Rodriguez和Laio于2014年提出的一种聚类分析算法。其原始文献名是在在 Science上发表的，论文名称为“Clustering by Fast Search and Find of Density Peaks”。这种聚类方法该算法是一种基于密度的聚类算法，可以自动确定聚类中心和聚类的数量并适用于处理各种形状和分布的数据集。
密度峰值聚类（Density Peak Cluster,DPC）——Python实现
Knight_ZJY的博客
06-29 5806
关于密度峰值聚类的算法思想，大师兄的博客中已经基本介绍了机器学习之Density Peaks_因吉的博客-CSDN博客_density peaks。在这里我就简述一下。对于样本空间而言，可以通过一定的距离度量来计算样本之间的距离。以当前样本为中心使用一个半径便可以计算样本周围的其他样本数量，便可衡量样本周围的密度。密度聚类算法便基于此。统计所有样本的密度，便可得到一个密度峰值图。将数据样本按照某一方向映射到x轴上，y轴为以其为中心，以r为半径计算的密度。由上图可以看到，样本1和样本......
DensityCluster.zip_-baijiahao_密度图_密度峰值算法_密度聚类_聚类 Python
07-14
本篇文章将详细讲解基于“密度图”和“密度峰值算法”的“密度聚类”方法，以及如何使用Python实现这一过程。 **密度图**是一种可视化工具，它展示了数据点在多维空间中的分布情况。通过这种方式，我们可以直观地...
DBSCAN聚类.rar_DBSCAN_python算法_密度峰值聚类_密度聚类python_峰值聚类算法
07-14
最近在Science上的一篇基于密度的聚类算法《Clustering by fast search and find of density peaks》引起了大家的关注(在我的博文“论文中的机器学习算法——基于密度峰值的聚类算法”中也进行了中文的描述)。...
密度峰值聚类算法总结及其python实现_Clustering聚类算法总结+python实践
weixin_39842918的博客
12-19 1375
本文以iris鸢尾花数据为例，实现各种聚类算法。文章里理论部分很简略，主要是python实践。没想到疫情期间度过了研一下学期，全在上网课，仍然是获益匪浅。正好在上机器学习的课程做了结课报告，感谢华中师大张雄军老师，疯狂鞭笞我们去实践，小白上了一学期机器学习学到很多，终于入门了呜呜呜~~~一、聚类算法聚类算法即分类算法。分类的输入项是数据的特征，输出项是分类标签，它是无监督的。为什么要聚类？对大量数...
基于加权K近邻的改进密度峰值聚类算法
04-30
通过在人工数据集上与UCI真实数据集上的实验，将该改进算法与原密度峰值聚类、K-means及DBSCAN算法进行了对比，证明了改进算法能够在密度不均匀数据集上有效完成聚类，能够发现任意形状簇，且在三个聚类性能指标上...
dpca:python sklearn方式实现密度峰聚类算法
04-27
密度峰聚类算法 sklearn方式的python实现。 文档 概述 class DensityPeakCluster ( object ): """ Density Peak Cluster. Methods: fit: fit model plot: plot clustering Attributes: n_id: data row count distance: each id distance dc: threshold of density cut off rho: each id density nneigh: each id min upper density nearest neighbor delta: each
DPC5_密度峰值_pythonDPC_
09-30
实现DPC 密度峰值的功能 代码功能标注完整
Python：密度峰值聚类DPCA，分裂两簇（版本：2）
DeniuHe的博客
11-15 670
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn import datasets from scipy.spatial.distance import pdist,squareform from collections import OrderedDict def getDistCut(distList,distPe...
密度聚类算法python详解_密度峰值聚类算法总结及其python实现
weixin_39728544的博客
11-28 552
密度峰值聚类算法总结及其python实现先上代码：#-*-coding:utf-8 -*-from __future__ import divisionimport numpy as npfrom sklearn import preprocessingfrom scipy.special import combfrom sklearn.metrics import adjusted_rand_s...
Python：正宗的密度峰值聚类
DeniuHe的博客
11-27 2208
import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt from scipy.spatial.distance import pdist,squareform from collections import OrderedDict from itertools import combinations,produ...
dbscan算法_Clustering聚类算法总结+python实践
weixin_39832875的博客
11-24 1339
本文以iris鸢尾花数据为例，实现各种聚类算法。文章里理论部分很简略，主要是python实践。没想到疫情期间度过了研一下学期，全在上网课，仍然是获益匪浅。正好在上机器学习的课程做了结课报告，感谢华中师大张雄军老师，疯狂鞭笞我们去实践，小白上了一学期机器学习学到很多，终于入门了呜呜呜~~~一、聚类算法聚类算法即分类算法。分类的输入项是数据的特征，输出项是分类标签，它是无监督的。为什么要聚类？对大量数...
密度峰值聚类算法总结及其python实现_基于密度峰值的快速聚类算法（CFSFDP）
weixin_42398843的博客
02-12 2587
这是Science上一篇聚类的文章：Clustering by fast search and find of density peaks(CFSFDP)。算法的思想很简单，但之前却没有人想到过。所以，仅仅是做聚类的人，也是有希望登大顶的。为了简化描述，我们称应该归为一类的数据为簇。作者首选讨论了k-means的不足，因为k-means方法将点聚类到临近的簇中去，导致无法处理非球面形状的簇。DBS...
密度峰值聚类算法总结及其python实现_密度峰值聚类算法——心得总结
weixin_39688870的博客
12-19 803
这是离开公司前做的最后一个算法，之前做的一些算法，由于老大的指点，少走了很多弯路，密度峰值聚类这个是纯粹自己做的，走了很多弯路，在这里和大家分享借鉴一下，共勉！一、简单介绍及原理顾名思义，这是一种基于密度的聚类算法，以高密度区域作为判断依据，这种非参数的方法，和传统方法比，适用于处理任何形状的数据集，而且无需提前设置簇的数量。这里提到一个聚类中心的概念：类簇的中心是由一些局部密度较低的点所围绕，且...
Tcl lnit error: Can’t find a usable init.tcl in the following directories 问题解决
最新发布
梦想闹钟
09-15 217
实际研究后发现，其实py2exe已经把打包需要的lib放在dist文件夹下了，但是打包后的程序运行后却没有去lib下找，而是去找系统自带的环境变量里找，所以找不到。这个问题出现在我用py2exe打包了一个包含tkinter的图形化界面，在当前电脑上运行无问题，在移动到新电脑上后提示报错、getcwd用于获取当前工作目录绝对路径，在设置环境的变量的时候它用的是绝对路径-所以也导致了在当前电脑上能用而移动后不能用。解决方法是在你的程序里重新设置下环境变量，而且是用相对路径的形式。
密度峰值聚类算法python
09-12
密度峰值聚类算法（Density Peak Clustering Algorithm）是一种基于密度的聚类方法，可以识别出具有高密度的数据点作为聚类...以上是一个简单的密度峰值聚类算法的Python实现，你可以根据自己的需求进行修改和扩展。
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