- 博客(6)
- 资源 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 利用Excel函数进行DNA不同特征区间的交集分析
利用Excel函数进行DNA不同特征区间的交集分析前言在NGS多组学研究中，通常需要将DNA不同特征区间的进行交集分析，在linux 系统中利用Bedtools intersect 工具即可快速高效的完成。在window下，利用excel 函数同样可以有效进行DNA不同特征区间的进行交集分析，本文利用的是SUMIFS条件求和函数进行筛选分析。首先需要熟悉掌握SUMIFS函数公式，可参考《数据处理中常用的Excel基本操作及函数》一文。其次，需要理解不同区间集合的交集，对哪一个对象集合进行筛选，限制条件参
2021-08-07 11:16:14
585
原创 免疫组库数据分析（三）：免疫组库数据可视化
免疫组库数据分析（三）：免疫组库数据可视化前言在系列文章第二篇《免疫组库数据分析（二）：Excel 分析免疫组库数据》中，分析了免疫组库中V基因、J基因、V-J组合的使用频率。在氨基酸水平，分析了CDR3 的氨基酸的长度分布以及20种氨基酸的使用频率；在免疫组库多样性方面，分析了4种不同的多样性指数。本篇将利用作图软件Graphpad prism 8以及Excel 将上述分析的数据进行可视化，此外利用在线工具分析CDR3 氨基酸保守性，或者两组样本CDR3长度的氨基酸差异。数据可视化1. 免疫组库
2021-06-12 21:39:02
5455
原创 免疫组库数据分析（二）：Excel 分析免疫组库数据
免疫组库数据分析（二）：Excel 分析免疫组库数据前言在系列文章第一篇《免疫组库数据分析（一）：windows 系统下MiXCR的安装和使用》讲解了5’RACE实验数据如何在Window系统下进行初步的比对拼接与输出文件操作。本篇将讲解如何利用Excel对CDR3克隆子输出文件进行分析。按照数据清洗、数据筛选及计算分析方面进行如下分析选择目的TCR链序列去除无效CDR3序列重新计算每一个克隆的所占比例计算克隆子中V、J基因的使用频率（Clone counts水平与Clone types水平）
2021-06-12 21:29:16
4204
1
原创 免疫组库数据分析（一）：windows 系统下MiXCR的安装和使用
免疫组库数据分析（一）：windows 系统下MiXCR的安装和使用前言： 免疫系统的T细胞或者B细胞免疫组库的多样性主要取决于抗原决定簇CDR3区域的多样性，CDR3区域有部分V基因的3端到J基因的5‘端序列构成，其中包含D基因。因此如何多维度的分析CDR3至关重要。 本系列文章分析小鼠 5’RACE实验数据，并在Windows 系统下用MIXCR进行初步分析，利用Excel进行进一步分析，利用Graphpad prism 8 以及在线绘图网站进行一系列的可视化分析。希望以少代码
2021-06-12 21:10:39
3539
3
原创 Pandas用法大全-实战英超版
Python Pandas 用法总结学习，从模仿开始，从练习开始，从自己熟悉喜欢的数据开始。一、生成数据表1. 引进 pandasimport pandas as pdimport numpy as npimport osos.chdir('D:\\jupter notebook')2.导入CSV或者xlsx文件：# Data1 = pd.read_csv('Data1.xlsx.csv',header=0)Data1 = pd.read_excel('2020-2021赛季英超第34
2021-05-07 16:38:30
384
原创 数据处理中常用的Excel基本操作及函数
数据处理中常用的Excel基本操作及函数文章目录数据处理中常用的Excel基本操作及函数第一部分：键盘快捷键操作一、CTRL系列二、其他系列第二部分：Excel函数一、清洗处理类1. 非函数类：1、数据拆分2、去除重复数据3、 筛选4、 排序2.函数类1、 Trim:清除字符串空格2、 CONCAT/CONCATENATE函数:连接单元格内的内容3、 LEFT/RIGHT/Mid函数:**截取左边/中间/右边字符串**4、 Replace/Substitute:替换单元格中内容5、 LEN/LENB 长度
2021-05-02 11:19:14
1432
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人