【scRNA-seq】R更新后Seurat包出现libstdc++.so.6: version ‘GLIBCXX_3.4.29‘ not found问题

在Rstudio中使用Seurat包时遇到GLIBCXX_3.4.29版本缺失的问题。通过查找和复制系统中更高版本的libstdc++.so.6文件到指定目录解决了这个问题。用户需要拥有管理员权限来执行文件替换操作。
摘要由CSDN通过智能技术生成

#libstdc++.so.6: version ‘GLIBCXX_3.4.29‘ not found报错
之前为了下载hdf5r包重启了Rstudio,再次打开发现Seurat包无法加载使用出现如下报错:

libstdc++.so.6: version ‘GLIBCXX_3.4.29‘ not found

查找后发现是/usr/lib/x86_64-linux-gnu/下一个文件的版本有问题,于是在终端先搜索所有文件里符合条件的该文件:

locate libstdc++.so.6

找到后确认一下你找到文件里的版本:

strings /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX_3.4.29

copy这个文件到/usr/lib/x86_64-linux-gnu/里(此步需要管理员权限):

cp /home/username/conda/x86_64-conda-linux-gnu/lib/libstdc++.so.6  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/

退出,重新打开Rstudio加在Seurat,问题解决。

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