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原创 interproscan的Linux安装
最新版本是interproscan-5.67-99.0,但是我下了以后安装的时候总报错,用md5文件检查提示文件不完整。所以我换了版本,下载了interproscan-5.54-87.0安装包。interproscan软件的安装可以完全按照InterProScan说明文档中的教程来操作:https://interproscan-docs.readthedocs.io/en/latest/index.html。perl,python3和java jdk的安装我是用的conda,很方便。
2024-05-27 09:55:26 396 1
原创 手把手教你安装SignalP6
将安装包里的distilled_model_signalp6.pt文件,拷贝到虚拟环境中软件的安装位置(前面是我的signalp6的安装路径,后面是创建的conda环境Singalp中python3.7组件的位置)网站,提交信息,等待邮件,获得下载链接,链接有效时间只有4小时,尽快下载。首先创建conda虚拟环境,使用python=3.7(方便安装依赖包)进入python中,验证上面4个依赖是否正确安装,以及版本是否正确。至此,signalp6已经安装成功啦!解压缩、安装、测试文件。来看一下help页面~
2024-05-21 10:47:18 349 1
原创 Python在虚拟环境miniconda中的安装(python3.7)
首先,可以在https://repo.anaconda.com/miniconda/下载对应的安装脚本,假如需要在linux x86_64上安装Python3.7,可以下载如图所示的脚本,然后运行脚本安装。执行脚本之后,需要按回车键Enter,然后继续安装,之后会出现安装协议,遇到More就按空格。再按回车键表示同意安装,脚本会往下继续安装。最后,若是需要加到环境变量的话,输入yes之后再按回车键,否则直接按回车键。再次,会出现是默认目录还是指定目录,指定目录的话,手动输入即可。
2024-05-21 09:27:00 315
原创 多个单细胞测序aggr合并文件的分解
但是明明Barcodes文件是存在的,搜索了之后,发现是因为Read10X函数期望读入的是通过早期版本的10X Genomics Cell Ranger软件(
2024-01-25 11:18:31 565 7
空空如也
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