【TorchIO】实现MRI图像分区、加载训练好的pt模型、无法解析加密的模型参数

TorchIO脑功能分区

代码示例

# 导入torchio库
import torch
import torchio as tio


# 读取MRI大脑图像文件，假设是nifti格式
image = tio.ScalarImage('./fernando/t1.nii.gz')


# 创建一个分区模型，假设是torchvision的UNet
from torchvision.models.segmentation import unet
model = torch.load("model.pt")


# 将图像转换为张量并送入模型，得到分区结果
tensor = image.data.unsqueeze(0) # 增加一个批次维度
output = model(tensor) # 得到一个字典，包含out和aux两个键
segmentation = output['out'].squeeze(0) # 取出out键对应的张量，并去掉批次维度


# 将分区结果转换为标签图像，并用颜色标签标记
labels = segmentation.argmax(dim=0) # 按通道维度取最大值的索引，得到一个整数张量
label_map = tio.LabelMap(tensor=labels) # 将整数张量转换为标签图像
colormap = tio.LabelMap.get_colormap() # 获取默认的颜色映射表
colored = label_map.apply_colormap(colormap) # 将颜色映射表应用到标签图像上，得到一个彩色图像


# 保存彩色图像为nifti文件
colored.save('brain_segmented.nii.gz')

这段代码使用了torchio库来读取和保存图像文件，并使用了PyTorch模型来进行分区：

1. 将一个MRI大脑图像文件转换为张量；
2. 使用一个预训练的分区模型对其进行分区；
3. 将分区结果转换为标签图像，并用颜色标签标记；
4. 将标签图像保存为nifti格式文件。

torch.load()加载训练好的pt模型

具体步骤如下：

1. 将训练好的PT模型保存为.pt文件，例如：model.pt；
2. 使用torch.load()函数加载模型。

import torch

# 加载训练好的PT模型
model = torch.load("model.pt")

# 对新数据进行预测
input_data = torch.randn(1, 3, 224, 224).float()
output = model(input_data)
print(output)

报错：“TypeError: ‘dict’ object is not callable”

解释：尝试调用一个字典对象（即dict）的“call”方法，而字典对象不是可调用的，因此无法使用“call”方法。

尝试解析pt文件的训练模型参数

# 获取pytorch训练的模型参数
params = model.parameters()
print(params)

# 获取tensorflow训练的模型参数
params = model.get_weights()
print(params)

# 加载PT格式模型文件，并将模型参数和词典信息保存在指定的路径下
model = torch.load("model.pt", map_location='cuda:0')

存在加密的pt模型或自定义参数的模型

解密模型

使用专门的加密算法解密PT模型内的参数和信息：

1. 确定解密的加密算法。例如，AES、RSA、RSA等常用的加密算法。
2. 比如，AES算法的解密可以使用常用的算法库包括PyCryptodome、PyCryptodome-Lite、PyCryptodome-Lite-Lite等。

解密代码

# 安装PyCryptodome库
pip install pycryptodome


# 导入PyCryptodome库
from Crypto.Cipher import AES

# 使用AES算法的加密函数加密PT模型文件
data = b'This is a secret message'
key = b'1234567890'
cipher = AES.new(key, AES.MODE_EAX)
ciphertext = cipher.encrypt(data)

# 使用AES算法的解密函数解密PT模型文件
plaintext = cipher.decrypt(ciphertext)

缺少密钥，无法解析

key是一个字节序列，用于指定加密密钥。