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原创 处理AAL的.nii文件:python获取AAL的各个区域的质心坐标

编号名字200120022101210221112112220122022211221223012302231123122321232223312332240124022501250226012602261126122701Rectus_L2702Rectus_R3001Insula_L3002Insula_R40014002401140124021402241014102411141124201。

2025-02-27 16:53:56 1015

原创 Learning Dynamic Graph Representation of BrainConnectome with Spatio-Temporal Attention文献笔记

输入动态FC图序列由4D fMRI数据和随时间变化的3D体素构建而成。通过在预定义的3D图谱中取平均值来提取ROI时间序列矩阵P,该图谱由每个时间点的N个ROI组成。每个ROI的值随着时间的推移而标准化。构建动态FC矩阵遵循滑动窗口方法,其中长度为Γ的时间窗口随时间以步长S移动去生成t个窗口,时间t处的FC被定义为两个窗口时间序列之间的相关系数矩阵R(t)最终的二进制邻接矩阵A(t)是通过将相关矩阵的前30个百分位值阈值化为连通值,否则为非连通值,从FC矩阵R(t)中获得的。

2025-02-20 21:01:16 809

原创 Multiple instance learning with graph neural networks文献笔记

采用基于GNN的可微池算法(Ying et al ., 2018)将具有不同节点数的图折叠为向量表示。2)在给定学习分配矩阵的情况下,通过软池化将图节点压缩为cluster的数量。cluster的数量是预定义的,对于不同的图是相同的。将每个包视为一个图,利用GNN学习包的嵌入,以探索包中实例之间有用的结构信息。使用(Zhou et al ., 2009)作者整理的20个文本分类数据集来验证基于GNN的MIL的性能。(2)构建一个基于GNN的MIL,输入(A,V),其中A是邻接矩阵,V是节点的特征矩阵,

2024-11-18 12:07:46 450

原创 Bag Graph: Multiple Instance Learning Using Bayesian Graph Neural Networks文献笔记

用图(贝叶斯GNN框架)来建模袋之间的相互作用,并使用图神经网络(gnn)来促进端到端学习。

2024-11-15 22:03:11 624

原创 A Graph-Transformer for Whole SlideImage Classification文献笔记

来实现。通过最小化自定义损失,池化层学习在任何给定的图上找到min-cut聚类,并聚类以减小图的大小。

2024-10-21 21:54:21 1256

原创 Toxicity Prediction in Pelvic Radiotherapy Using Multiple Instance Learning and Cascaded Attention L

Toxicity Prediction in Pelvic Radiotherapy Using Multiple Instance Learning and Cascaded Attention Layers文献笔记。

2024-09-30 16:22:13 1183

原创 TransMIL: Transformer based Correlated Multiple Instance Learning for Whole SlideImage Classificatio

TransMIL: Transformer based Correlated MultipleInstance Learning for Whole SlideImage Classification文献笔记

2024-09-29 21:57:46 893

原创 Leveraging Unlabelled Data in Multiple-Instance Learning Problems for Improved Detection of Parkinso

Leveraging Unlabelled Data in Multiple-Instance Learning Problems for Improved Detection ofParkinsonian Tremor in Free-Living Conditions文献笔记

2024-09-29 14:42:24 776

原创 Convolutional Multiple Instance Learning for SleepSpindle Detection With Label Refinement文献笔记

Convolutional Multiple Instance Learning for SleepSpindle Detection With Label Refinement文献笔记

2024-09-28 23:56:13 749

原创 VS Code include<iostream>报错

"cannot open source file \"iostream\". Please run the 'Select IntelliSense Configuration...' command to locate your system headers."

2024-09-23 10:01:36 4491

原创 Multiple Instance Learning via Iterative Self-Paced Supervised Contrastive Learning 文献笔记

阅读Multiple Instance Learning via Iterative Self-Paced Supervised Contrastive Learning 后写下的文献笔记

2024-09-11 15:27:35 868

原创 报错RuntimeError: CUDA error: device-side assert triggered

之前用这个代码跑的是二分类的问题 现在跑的是五分类的问题 但是n_class没有修改 所以报错了。在改了n_class之后 就没有报这个错误了。我刚开始也想不清楚到底是发什么什么错误了。但是后面突然发现 是因为。

2024-05-08 11:27:03 214 1

原创 Java中有关 Map和HashMap的使用总结

Map是一个 <key,value>的映射结构理解:转换一下思路 ,我认为 在某种程度上 key相当于是函数中的自变量x,value是函数中的应变量y,而Map用于反映自变量和应变量之间对应关系,故 不难理解,key不可重复,value可重复,每一个key都有唯一其确定的value值Map<key,value> 对象名=new 子类<key,value>();

2024-05-02 18:49:36 752 2

原创 attributeerror: module ‘timm.optim.optim_factory‘ has no attribute ‘add_weight_decay‘

后来发现 应该是我的版本过高了 所以我先卸载了timm 然后换了低版本的timm。在网上搜索答案,说是timm版本不够新 但是我的timm应该版本是最新的0.9.x。在复现一个project的时候,遇到报错。

2024-04-28 17:03:30 1235 1

原创 CrossEntropy报错RuntimeError: “nll_loss_forward_reduce_cuda_kernel_2d_index“ not implemented for ‘Int‘

不能为float或者int 需要转化为long。在进行损失函数计算时 使用交叉熵损失函数。这是因为label的数据类型。

2024-04-11 09:31:37 293

原创 RuntimeError: “mse_cuda“ not implemented for ‘Long‘

这时候需要把outputs和targets的数据类型转化为浮点数float。在使用均方误差损失函数MSE时。

2024-04-10 21:18:22 794 1

原创 numpy中在某一维度拼接数组 concatenate和stack的区别

在按照某一维度拼接数组时,最为常用和灵活的拼接是stack和concatenate。我们分别使用stack和concatenate来在第二维度上拼接A和B两个数组。但它们的效果也有一定的区别。

2024-03-31 10:51:16 346 1

原创 使用巴特沃斯滤波器从EEG信号中分出五个频段的波

本文使用Butterworth滤波器将EEG信号分成了五个频段

2024-03-30 11:07:39 1762 2

原创 python 随机打乱数组排序

【代码】python 随机打乱数组排序。

2024-03-26 10:18:16 543 1

原创 学习笔记——Markdown基本语句

因为最近用到了jupyter,所以稍微接触到了一点Markdown,故记了一些本人可能以后会用到的相关语法。详细可以看。

2024-03-25 14:49:28 369

原创 复现异常检测USAD时无法下载数据集

上面的这段代码运行错误,不能正常地访问谷歌来下载所需要的数据集。将它们放在usad/input文件夹里就能正常运行源码啦。将USAD这篇论文介绍的很详细QAQ。根据文章中给出的源码。

2024-03-22 09:00:00 570 1

原创 问题AttributeError: module ‘keras.utils‘ has no attribute ‘to_categorical‘

【代码】问题AttributeError: module ‘keras.utils‘ has no attribute ‘to_categorical‘

2024-03-21 09:45:29 1016 1

原创 使用Pycharm远程使用Jupyter

由于最近几天要复现的代码是用Jupyter写的,所以花了一些时间在这上面。

2024-03-20 11:45:52 1741 1

原创 在远程使用jupyter时 设置密码报错No module named ‘notebook.auth‘

在遇到这个问题之后 发现 是jupyter版本的问题 在新版本的jupyter中,没有notebook.auth。可以卸载jupyter重装6.或者更低版本的jupyter就可以啦。

2024-03-20 10:06:55 2027 1

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