DICOM文件生成时,必须要有的字段

DICOM文件必要的元信息标签:

· MediaStorageSOPClassUID (0002,0002): 用于指定存储对象的类UID,例如 "Secondary Capture Image Storage"。

· MediaStorageSOPInstanceUID (0002,0003): 用于唯一标识存储对象的实例UID。

· TransferSyntaxUID (0002,0010): 指定传输语法UID,用于定义数据的编码方式。

· ImplementationClassUID (0002,0012): 用于唯一标识实现的类UID。

· ImplementationVersionName (0002,0013): 用于标识实现的版本名称。

· SourceApplicationEntityTitle (0002,0016): 标识创建该文件的应用实体标题。

数据集中必要的标签

·SOPClassUID (0008,0016): 存储对象的类UID。

·SOPInstanceUID (0008,0018): 存储对象的实例UID。

·PatientName (0010,0010): 患者姓名。

·PatientID (0010,0020): 患者ID。

·StudyInstanceUID (0020,000D): 研究实例UID。

·SeriesInstanceUID (0020,000E): 序列实例UID。

·PhotometricInterpretation (0028,0004): 图像的光度解释,如 "RGB" 或 "MONOCHROME2"。

·Rows (0028,0010): 图像的行数。

·Columns (0028,0011): 图像的列数。

·BitsAllocated (0028,0100): 为每个像素分配的位数。

·BitsStored (0028,0101): 每个像素存储的位数。

·HighBit (0028,0102): 每个像素高位的位数。

·SamplesPerPixel (0028,0002): 每个像素的样本数

除此之外就是图像数据了~

要使用SimpleITK库导入DICOM文件生成STL文件,您可以按照以下步骤操作: ```python import SimpleITK as sitk import vtk def dicom_to_stl(dicom_dir, output_stl): # 读取DICOM序列 reader = sitk.ImageSeriesReader() dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_dir) reader.SetFileNames(dicom_names) image = reader.Execute() # 使用Marching Cubes算法提取表面 surface_extractor = sitk.MarchingCubes() surface_extractor.SetInput(image) surface_extractor.SetValue(0, 1000) # 根据实际需求设置阈值 # 将表面转换为vtk数据类型 surface = surface_extractor.GetOutput() surface_array = sitk.GetArrayFromImage(surface) vtk_data = vtk.vtkImageData() vtk_data.SetDimensions(surface_array.shape[::-1]) vtk_data.AllocateScalars(vtk.VTK_UNSIGNED_CHAR, 1) vtk_data.GetPointData().SetScalars(vtk.util.numpy_support.numpy_to_vtk(surface_array.ravel(), deep=True)) # 使用vtkSTLWriter将表面写入STL文件 stl_writer = vtk.vtkSTLWriter() stl_writer.SetFileName(output_stl) stl_writer.SetInputData(vtk_data) stl_writer.Write() dicom_dir = "path/to/dicom/files" output_stl = "path/to/output.stl" dicom_to_stl(dicom_dir, output_stl) ``` 请确保您已经安装了SimpleITK和vtk库。在代码中,您需要将`dicom_dir`替换为包含DICOM文件的目录的路径,并将`output_stl`替换为要生成的STL文件的路径。 与之前的代码示例相比,这里使用了SimpleITK库而不是pydicom库来读取DICOM文件。然后,我们使用SimpleITK的Marching Cubes算法提取表面,并将表面数据转换为vtk数据类型,最后使用vtkSTLWriter将表面写入STL文件。 请注意,阈值的设置可能需要根据您的DICOM文件的实际情况进行调整。 希望对您有帮助!
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