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RSS订阅原创 CBF数据预处理（GE）
Segment:把刚重采样后的rT1文件进行分割，产生分割矩阵rT1_seg_sn.mat，以及反分割矩阵rT1_seg_inv_sn.mat(合并文件的时候用到，这里用不到)另一种是Coregister（Est&Writ）---- Segment ---- Normalise（Writ）目的为了产生rT1，即把T1进行cbf格式重采样，所以reference为cbf，source为T1。有两种，一种是一步直接配准，即Normalise（Est&Writ）;这里我们使用dpabi里面的功能进行标准化。
2024-02-04 12:39:48
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原创 使用SPM_batch进行批量跑脚本（matlab.m）
下面这里是show.m产生的原始脚本。可以看出我们只是把绿色部分用循环语句替换了。后面的脚本来自spm-view-show.m code。软件：spm8+matlab2023b+win11。
2024-02-04 11:20:23
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原创 wsl2安装fsl
安装完毕之后，终端输入命令glxgears判断vcxsrv是否可用若有三个轮子即可用， 然后将三个齿轮关闭，并将vcxsrv挂起，使用Ubuntu终端输入 sudo gedit /etc/profile 打开写字板，（此时写字板是会出现在vcxsrv中的，在这里可以编辑，然后保存退出后Ubuntu终端才能继续输入其他命令） 在写字板文件最后位置输入以下命令。原文链接：https://blog.csdn.net/ZincTsang/article/details/127428437。
2023-10-19 12:47:01
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原创 fslmaths/fslstats/fslmeants
tensor_decomp : 将4D(6-timepoint)张量图像转换成L1,2,3,FA,MD,MO,V1,2,3(管道中剩余的图像为FA)-kernel boxv3 : 以目标体素为中心，尺寸为X x Y x Z的立方体中的所有体素，注意：尺寸应该是奇数。-thrp : 使用以下ROBUST RANGE的百分比(0-100)对当前图像进行阈值设置(低于该数字的部分为零)-kernel boxv : 以目标体素为中心，宽度为的立方体中的所有体素，注意：尺寸应该是奇数。
2023-10-07 22:29:42
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原创 TBSS数据分析
步骤三：统计数据（例如，随机化） - 将 4D 投影 FA 数据输入 GLM 建模和阈值，以找到与您的模型相关的体素。tbss_4_prestats - 将所有受试者的 FA 数据投影到平均 FA 骨架上。tbss_1_preproc - 以正确的格式在TBSS工作目录中准备FA数据。tbss_2_reg - 将所有FA图像的非线性配准应用到标准空间中。tbss_3_postreg - 创建平均 FA 图像并将其骨架化。步骤一，指标解算：求解出FA，MD，AD，RD指标。
2023-09-22 20:08:14
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原创 qform sform
关于 qform 和 sform 的文档核磁共振数据图像的坐标系统——从世界坐标系到图像坐标系的理解与转换，从矩阵坐标转换至MNI坐标
2023-04-29 01:59:29
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原创 网站不可访问？
然后查询相对应的IPv4地址。然后把IPv4地址添加到host文件。使用这个命令编辑hosts文件。例如网站raw.githubusercontent.com拒绝访问。
2023-04-13 22:28:50
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原创 使用 FSL 和 TrackVis 分析 DTI 数据
使用 FSL 和 TrackVis 分析 DTI 数据弥散加权成像（Diffusion Weighted Imaging, DWI）通过测量水分子的弥散程度来反映水分子所处的组织结构特点，弥散张量成像（Diffusion Tensor Imaing, DTI）通过张量模型来定量地刻画水分子的弥散程度，也是最简单的一种模型。作为初学者，总结一下使用 FSL 和 TrackVis 进行 DTI 数据分析的基。
2023-03-18 20:58:23
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原创 自动化纤维束定量AFQ概述1
然后将预处理的扩散加权图像和ACPC对齐的T1加权图像输入到自动纤维量化（AFQ）软件中（Yeatman等人，2012）。AFQ程序基于（Hua等人，2008）和（Zhang等人，2008）描述的方法的组合，可以总结为6个步骤：（1）对每个受试者进行全脑牵引术，其中所有纤维都用白质掩模跟踪，白质面罩定义为FA值为>0.3的所有体素;因此，AFQ管道产生一组“束轮廓”，用于测量从束芯开始到结束的等距样品位置（100个节点用于我们的分析）的组织特性（FA，RD，AxD和MD）。基于matlab软件。
2023-03-16 21:23:48
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原创 删除Windows10+Linux20.04双系统环境中的Linux系统
删除Windows10+Linux20.04双系统环境中的Linux系统
2022-11-30 21:34:18
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用于自动纤维定量分析AFQ的软件包AFQ1.2
2023-03-17
用于自动纤维定量分析AFQ的软件包1/3：vistasoft
2023-03-17
用于小脑神经影像数据处理软件SUIT
2022-11-04
ICA_inter_network_connectivity_by_Vince_Calhoun2011.m
2022-10-04
空空如也
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