基于spm12对fmri数据的分析

  1. 任务描述

这批数据来自于spm12(https://tinyurl.com/scelanz)官网,被试需要做2个runs,如下图所示,需要对箭头的方向做出反应,箭头朝右就按右键,朝左按左键,这批数据中有被试的反应时,准确率,可以在此文件夹用txt形式打开(sub-01_task-flanker_run-2_events.tsv)。

 2.数据整理

2.1 观察结构像和功能像

在MATLAB的命令窗口行输入 spm fmri,我们还需要将*.gz数据进行解压,可以用命令gunzip('*.gz')。

按照下图,点击Display,同样功能像也可以这样加进去,我们还可以看每个被试的时间序列信息

 观察功能像:

 

 

 3.预处理

预处理的顺序如下图所示:

 !Note:不同的软件包预处理的顺序有所不同,如果我们做的是multi-voxel 模式,则不需用做平滑这一步。

3.1 realignment

 

 

添加数据:双击session按钮,找到需要添加数据的文件夹路径,选择sub-08_task-flanker_run-1_bold.nii,1 “1”是第一个frame或者volume,我们需要在Filters下面输入1:146(如果不知道多少个volumes,就输入1:1000,这样就会把所有的volumes加载进去),然后点击enter,右键select all,点击done,就得到一个run的所有数据。如下图所示。

为了精确找到文件,在 .* 的左边输入run-1。

 3.2 Slice-Timing Correction

 因为我们得到的fMRI数据是在不同的时间点扫描的,因此我们需要做一些处理将这些数据看似在同一个时间点上获得的。

(未完待续。。。。)

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