纵向数据分析学习笔记-day1

学习途径：应用R语言进行纵向数据分析（一）

一、“纵向数据是分层数据的一种特例，其中观测值嵌套在不同的分层顺序级别中。”举个例子理解

该例出自文心一言

假设我们正在研究一种新药的治疗某一种疾病的效果。我们收集了一组患者的数据，包括他们的年龄、性别、疾病严重程度、药物治疗方案以及在接受治疗后的不同时间点的健康状况。具体数据如下：

患者1：男性，年龄45岁，疾病严重程度为中度，接受药物治疗A，治疗后1个月健康状况为良好，治疗后3个月健康状况为优秀，治疗后6个月健康状况为良好。

患者2：女性，年龄32岁，疾病严重程度为轻度，接受药物治疗B，治疗后1个月健康状况为优秀，治疗后3个月健康状况为良好，治疗后6个月健康状况为优秀。

患者3：男性，年龄51岁，疾病严重程度为重度，接受药物治疗A，治疗后1个月健康状况为良好，治疗后3个月健康状况为优秀，治疗后6个月健康状况为良好。

通过分析这些数据，我们可以得出以下结论：

1. 药物治疗方案对患者的健康状况有影响。接受药物治疗A的患者中，有两位患者的健康状况在不同时间点都得到了改善；而接受药物治疗B的患者则在较早的时间点就已经达到了良好的健康状况。这表明药物治疗A可能比药物治疗B更有效。
2. 年龄和疾病严重程度等因素可能影响了患者对药物的反应。例如，年龄较轻的患者（如患者2）可能在较早的时间点就达到了良好的健康状况；而年龄较大的患者（如患者1和患者3）则需要更长的时间才能改善健康状况。这表明对于不同的患者群体，需要制定不同的治疗方案以达到更好的治疗效果。
3. 治疗效果随时间变化。在每位患者中，健康状况都是在不同的时间点进行观测的，这些观测值的变化趋势可以反映治疗效果的变化情况。例如，在患者1中，随着时间的推移，健康状况逐渐改善；而在患者2和患者3中，虽然初期健康状况较差，但随着时间的推移，健康状况逐渐改善。这表明这种新药物的治疗效果是随着时间的推移而逐渐显现的。

首先，每个患者都可以被视为一个独立的分层。这是因为每个患者都有自己的特性，如年龄、性别、疾病严重程度等，这些因素导致了患者之间的异质性。因此，每个患者的观测值是嵌套在患者这个分层中的。

其次，对于每一个患者，我们在不同的时间点（例如，治疗后1个月、治疗后3个月、治疗后6个月）观测其健康状况，这些时间点也可以被视为一个分层顺序级别。这就是“观测值嵌套在不同的分层顺序级别中”的体现。

因此，在这个例子中，观测值（患者的健康状况）是嵌套在两个不同的分层顺序级别中的：一个是患者层级，另一个是时间点层级。这就是纵向数据分析中的“观测值嵌套在不同的分层顺序级别中”的概念。

二、”重复测量报告为单独的行“理解

如果一个数据被重复测量或记录，那么每一次的测量或记录都将被视为一个独立的行。

比如在医学研究中，如果我们要收集一个患者的多个时间点的血压数据，那么每一个时间点的血压数据都将被视为一个独立的行。如果我们将这些数据输入到表格或数据框中，那么每个时间点的数据都将占据一行。这样做可以方便我们分析和比较不同时间点的数据。

三、cov2cor(cov_obs)

这个函数的作用是将协方差矩阵转换为相关系数矩阵。

• cov2cor: 这是R语言中的一个函数，用于将协方差矩阵转换为相关系数矩阵。
• cov_obs: 这是传递给cov2cor函数的参数，代表观察到的协方差矩阵。

在统计学中，协方差矩阵是一种描述一组随机变量之间的协方差关系的矩阵。协方差矩阵的性质反映了各个变量之间的协方差关系。例如，如果协方差矩阵的对角线元素为正，说明该变量与其自身的协方差为正，即该变量存在正向的自相关性；如果对角线元素为负，说明该变量与其自身的协方差为负，即该变量存在负向的自相关性；如果对角线元素接近0，说明该变量与其自身的协方差接近0，即该变量不存在明显的自相关性。协方差的正负性反映了两个变量的变化趋势是否一致。此外，协方差的绝对值大小还可以表示两个变量相关程度的强度，即绝对值越大，两个变量的相关程度越强。

相关系数矩阵则是描述这些变量之间线性关系强度和方向的矩阵。相关系数是一种衡量两个变量之间线性关系强度的指标，其值范围在-1到1之间。相关系数的正负表示两个变量之间的线性关系是正相关还是负相关，而相关系数的绝对值大小则表示了线性关系的强度。在相关系数矩阵中，对角线元素均为1，因为一个变量与其自身的相关系数总是为1。

四、下图怎么看

主对角线：主对角线上的图像是各个变量的直方图（或密度图），用于展示单一变量的分布情况。

下半部分（下三角区域）：这部分是散点图矩阵，用于展示两个变量之间的关系。如果你选择了continuous = "smooth"，那么对于数值型变量，它还会在散点图上加上一个平滑的拟合曲线，帮助你更好地看出变量间的趋势。

上半部分（上三角区域）：这部分展示了两个变量之间的相关性系数（通常是皮尔逊相关系数）以及相关性的显著性水平（p值）。这些数值可以帮助你量化地理解两个变量之间的线性关系强度。

结语：刚开始学，比白纸还要白上三分，不对的地方请指正，有空看我总结这些的大佬，希望可以指导一下我，感激不尽！