利用dpabi和restplus提取ROI灰质体积学习笔记

前言

我利用SPM/CAT12进行灰质、白质、脑脊液分割之后分别已经得到各自的图像文件，在全脑水平已经做了统计分析。如果还想要进一步进行ROI的统计分析或者与量表等临床资料做相关分析，就需要提取ROI灰质体积。几个月没动过这数据了，突然心血来潮想学一下如何提取ROI灰质体积，以此篇博客记录我的提取ROI灰质体积学习过程。提取ROI灰质体积的方法及软件有许多种，本人尝试了dpabi和restplus。

一、数据准备

我采用的是SPM/CAT12 DARTEL分割后的灰质图像，即mwp1等文件，如果是采用dpabi分割的话，灰质图像文件则是wmc1等文件。我有两个组的数据，我是分开提取的，因此新建两个文件夹，按照个人习惯命名，我分别命名为“patient”，“control”。control文件夹如下

二、利用dpabi提取ROI灰质体积

1、安装dpabi
下载dpabi安装包，打开MATLAB，设置dpabi路径，设置路径我就不贴图了想必大家都已经十分熟悉了
2、MATLAB命令行输入dpabi,打开dpabi,选择Utiliti