单细胞-Seurat的构建以及数据质控

对于目前的bulk转录组数据，已经开始普及，接下来的单细胞转录组测序可能将再次重新登上舞台。

早在2013年《科学》杂志（Science）将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首，认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术随着计算机技术的进步，近年来在医学及生物学领域正在奋力地发展 ，其技术原理可以解析不同系统发育和疾病过程中的细胞异质性和相应转录组特点变化。

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单细胞测序技术原理

“单细胞测序技术，顾名思义，以单个细胞作为对象，通过对单个细胞遗传物质均匀扩增，标记建库后进行测序，最后对单个细胞基因组或转录组展开数据分析，其技术原理主要包括单细胞分离、扩增测序和数据分析3方面。”

”单细胞分离：主要包括荧光激活细胞分选法( flow- activated cell sorting ，FACS) 以及微流控分选法( microfluidics) 等。市场上，较成熟的商业单细胞测序公司主要有 10X Genomis 公司 的Chromium( 液滴法) 及 BD 公司的Ｒhapsody( 微孔法)。”

”液滴法通过特制凝胶微珠与单细胞悬液混合，使单个细胞与凝胶微珠结合，通过微流控技术将细胞输入油相孔道，形成“油包水”; 凝胶微珠表面有数百万份寡核糖核苷，含有特异性条形码( feature barcode) 、特异分子标签( unique molecular identifier， UMI)”

“小提示：barcode和UMI是单细胞中常见的名词，barcode就像是每个凝胶微珠的身份证号码；而U