weixin_53347816的博客

第一步：先搭建初末态结构，如要算Li离在LiAg表面的扩散路径，先在Materials Project中找到LiAg的结构并导出.cif文件，然后导入到ms中，发现是一个体心立方，建3x3x3的超胞，挖出一个Li原子作为初态，然后进行结构优化，得到的结构命名为IS；...

画离子扩散路径图只需要vesta和插点后生成的POSCAR。用neb方法插点后会生成几个文件夹（中间态），里面有POSCAR文件，依次按顺序将POSCAR导入vesta中，会发现离子大致的扩散路径，要注意：如挖掉了7号Li原子（初态结构），然后旁边的8号Li原子慢慢扩散移动到原7号Li原子的位置上，末态结构是原8号位置没有Li原子，原7号位置上有Li原子。画离子扩散路径图需要手动把所有中间态的POSCAR都放到一个POSCAR里，注意：不是用cat命令整合所有的POSCAR，而是只把迁移原子的xyz坐标