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原创 Stacked Autoencoder Based Multi-Omics Data Integration for Cancer Survival Prediction
该论文提出了一种基于堆叠自编码器的多组学数据整合方法 SAEsurv-net,用于癌症生存预测。通过两阶段降维和堆叠自编码器模型,有效解决了多组学数据的高维和异质性问题,实验结果表明该方法在多个癌症数据集上表现优于现有方法。
2025-03-10 20:18:07
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原创 Integrating multi-omics data through deep learning for accurate cancerprognosis prediction
该篇论文使用去噪自编码器(DAE)处理高维多组学数据,获取隐层特征,减少数据噪声影响,增强模型鲁棒性。将 DAE 提取的特征输入 Cox 比例风险模型,评估患者的癌症风险。针对多组学数据获取困难的问题,使用 mRNA 数据训练 XGboost 模型拟合风险,提高模型的可解释性和临床适用性。通过实验分析各类型组学数据对预后预测的贡献,发现 mRNA 数据的贡献最大,单独使用时平均 C-index 值为 0.628,而 CNV 数据贡献最小。
2025-03-10 16:40:55
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原创 解决 torchtext.data.Field 被移除的办法
降低torchtext版本同时需要降pytorch版本以适配,高版本torchtext将Field方法移除了,只能采用降低版本的方法继续使用在新版本中移除的方法。
2024-10-12 23:03:16
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原创 解决UserWarning: The NumPy module was reloaded
一种可能解决UserWarning: The NumPy module was reloaded的办法
2024-07-15 17:11:25
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