R语言限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析：基于logistic回归模型、南非心脏病数据集（South African Heart Disease）

最新推荐文章于 2024-08-13 14:36:52 发布
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分类专栏： R语言：入门+数据分析+机器学习 文章标签： 开发语言 数据分析 python
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本文利用R语言的限制性立方样条(RCS)分析，探讨logistic回归模型中南非心脏病数据集的非线性关系。通过对收缩压、吸烟量等预测因子进行样条化分析，发现非线性P值虽不显著，但依然进行了RCS建模。最优节点数为3，展示了限制性立方样条在数据分析中的应用。
摘要由CSDN通过智能技术生成

R语言限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析：基于logistic回归模型、南非心脏病数据集（South African Heart Disease）

目录

R语言限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析：基于logistic回归模型、南非心脏病数据集（South African Heart Disease）

#限制性立方样条图（Restricted cubic spline，RCS）

#导入包和库

#导入数据并获取最佳的节点个数

#连续变量样条化分析

#提取p值、设置参考点值、数据打包

#模型预测OR值、logistic回归模型限制性立方样条分析结果可视化

#限制性立方样条图（Restricted cubic spline，RCS）

在病因推断、剂量效应研究中，时常要分析自变量和因变量的数量关系。广义线性模

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R语言rms包生存分析之限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析详解实战:拟合连续性自变量和事件风险之间的关系：基于survival包lung数据
data+scenario+science+insight
10-01 5209
R语言生存分析之限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析详解实战:拟合连续性自变量和事件风险之间的关系：基于survival包lung数据 目录 R语言生存分析之限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析详解实战:拟合连续性自变量和事件风险之间的关系：基于survival包lung数据 #限制性立方样条图（Restricted cubic spline，RCS） #导入包和数据 #数据格式转换 #cox比例风险模型构.
限制立方样条（RCS）做生存分析
weixin_46587777的博客
04-13 1582
研究数据通常来自于观察某个特定群体的个体，并收集其相关信息。这些数据可以是从临床试验、队列研究、调查问卷等途径获得的。数据的特征通常包括个体的生存时间、生存状态（例如是否死亡）、危险因素（例如年龄、性别、治疗方案等）以及其他可能影响生存的变量。「限制立方样条的原理和优势」限制立方样条是一种非参数的拟合方法，通过将连续变量（如生存时间）转化为多个分段函数来建模生存曲线。RCS在建模过程中不对数据分布作出假设，因此适用于各种类型的生存数据。与传统方法相比，RCS具有更高的灵活性，可以更准确地拟合生存曲线的形状。
如何利用logistic回归快速绘制优美的RCS曲线？
qq_37610365的博客
08-13 133
是一种常见的统计方法，若自变量x与因变量y之间存在非线性关系时，可以使用RCS曲线来初步探索！，才可以达到美观的效果，较为繁琐！在医学研究领域，限制性立方样条。然而，目前应用比较多的R语言。需要许多代码参数调整进行美化。
R语言12篇文章带您深入了解限制立方条图（Restricted cubic spline，RCS）
dege857的博客
10-06 9494
临床上，因变量和临床的结局有时候不是线性关系，而回归模型有一个重要的假设就是自变量和因变量呈线性关联，因此非线性关系模型用回归分析来拟合受到限制。因此，一个更好的解决方法是拟合自变量与因变量之间的非线性关系，限制性立方样条(Restricted cubic spline，RCS)就是分析非线性关系的最常见的方法之一。6.绘制复杂抽样设计数据（NHANES数据）的限制立方条图，虽然市面上有多种做法，回头来看，还是我这种比较靠谱。3.基于RMS包的逻辑回归和线性回归的限制立方样条图，是对上一篇文章的扩展。
R语言基于Logistic回归绘制限制性立方样条图（Restricted Cubic Spline）
m0_61115677的博客
08-21 3万+
相关介绍： 在病因推断、剂量效应研究中，时常要分析自变量和因变量的数量关系。广义线性模型，如Logistic回归、Possion回归等是应用比较广泛的方法。它的一个重要假设是通过选择合适的链接函数，因变量与自变量的关系呈线性。这个假设在某些情况下并不成立。 此时一个常见的处理是采用百分位数等方法将连续性变量分段(P value for trend)。但是分段往往主观，而且损失信息，并有可能引入偏倚。本文介绍限制性立方样条拟合自变量和因变量之间的非线性关系。 限制性立方样条中节点的个数(k)和...
限制性立方样条（Restricted Cubic Spline）
热门推荐
姚巨龙的博客
07-03 3万+
限制性立方样条函数 (restricted cubic spline,RCS) 属于多项式中的一种，最大的特点在于它进行了样条插值并对趋势首尾两端进行了线性限制，即在第一个节点前的趋势和最后一个节点后的趋势强制限制为线性。.....................
R绘制logistic回归限制性立方样条图
kaiming000的博客
01-11 2515
通常的结果是一条曲线。通过曲线可以判断转折点。
一看就会R语言绘制限制性立方样条（Restricted cubic spline，RCS）
笑不语的博客
08-24 1万+
一、背景介绍 最近在研究怎么处理论文数据，各种分析软件都有使用，比如：SPSS、Origin、stata16、medcalc和R语言都有些研究，其中除R语言外都是收费的。不过经过一番功夫，我这边有SPSS、stata16、Origin和medcalc的破解版，有需要的可以关注我的公众号，私聊我来获取，我将给你一个百度网盘下载地址。 二、R语言的安装 1. 下载 链接：https://pan.baidu.com/s/1HRhArXuufO1Q00m_krIx7Q 提取码：r4p0 复制这段内容后打开百度网
R语言绘制复杂抽样设计logistic回归限制立方样条图（RCS）
dege857的博客
10-09 7964
上图只显示了一部分，这是一个转移性胃癌患者（Power、Capanu、Kelsen 和 Shah 2011）的数据（公众号回复：胃癌数据，可以获得数据），数据很多我们选取一部分建模，age_dx：年龄，group：分组变量，分为存活率小于2年的和大于两年的，inv_weight：概率权重，ssize：每个分组患者的人数，survival生存时间，surv_cens生存结局。prob 指定的抽样概率对于长期幸存者组（≥ 24月）中的患者等于 1，对于存活不到 2 年的患者均等于 253/853=0.296。
Restricted cubic splines
FanJin的博客
06-30 1万+
本文主要译自：Restricted cubic splines，翻译加上自己的理解，整理如下。 在统计学里，splines 技术用来对变量进行转换。有时候我们会将连续性变量转化为分类变量（哑变量化），因为该连续性变量与结局变量之间的线性关系比较差。比如建立疾病预后模型时，年龄这个变量通常会被通过选取一个合适的界值转化为分类变量。然而，很多大佬并不推荐使用分类变量。生统大佬FrankHarr...
如何利用线性回归绘制RCS曲线？
fengbaotongji的博客
05-06 263
在医学研究领域，限制性立方样条（Restricted Cubic Splines, RCS）是一种常见的统计方法，若自变量x与因变量y之间存在非线性关系时，可以使用RCS曲线来初步探索！然而，目前应用比较多的R语言需要许多代码参数调整进行美化，才可以达到美观的效果，较为繁琐！因此，这里推荐大家使用风暴统计平台绘制，可以大大缩短绘图时间！图片细节也都支持菜单式操作调整，代码小白也可以轻松上手！下面我...
R语言实现限制性立方样条拟合（1）
weixin_49320263的博客
06-10 253
R语言实现限制性立方样条拟合（1）
基于rms包的限制性立方样条回归（RCS）R代码实现
2301_79584199的博客
10-16 1万+
RCS
R绘制基于Cox回归模型的限制性立方样条图
kaiming000的博客
01-13 2717
R绘制基于Cox回归模型的限制性立方样条图。
R语言绘制限制立方条图2（基于logistic回归和线性回归）
dege857的博客
05-17 2万+
临床上，因变量和临床的结局有时候不是线性关系，而回归模型有一个重要的假设就是自变量和因变量呈线性关联，因此非线性关系模型用回归分析来拟合受到限制。因此，一个更好的解决方法是拟合自变量与因变量之间的非线性关系，限制性立方(Restricted cubic spline，RCS)就是分析非线性关系的最常见的方法之一。 既往教程中我们介绍了使用R语言在COX回归模型基础上绘制限制立方条图，后台有不少粉丝说道不会制作logistic回归和线性回归的限制立方条图，我们今天分别来讲讲。 先讲logistic回归绘制立方
R绘制线性回归限制性立方样条图
kaiming000的博客
01-12 2499
接上一期关于logistic回归的限制性立方样条，本期介绍基于线性回归模型的限制性立方样条图。变量要求：x为连续性变量，y为连续性变量。其他协变量既可以是分类变量，也可以是连续变量。今天展示的是年龄对BMI的影响，自变量因变量协变量ageBMI地区、sex、睡眠时间同样的，直接看数据形式和最终的效果图：数据情况：这里展示前几行结果图如下：.libPaths()#查看R包位置##这里改成自己电脑的路径setwd("C:/Users/12974/Desktop/百度经验/简书/R绘制限制性立方样条图")#设置工
R语言限制性立方样条回归
医学和生信笔记的博客
01-11 7072
前面用了2篇推文，帮大家梳理了的常用方法，包括今天主要介绍R语言实现。读过上面几篇推文的朋友想必已经知道了（没看过的建议先看看），样条回归包括很多种，限制性立方样条只是其中一种，更多的大家可以自己了解。
限制性立方样条图 R语言实现
m0_65623142的博客
03-08 1805
大多数研究者推荐的节点为3-5个。绝大多数情况下, 节点的位置对限制性立方样条的拟合影响不大, 而节点的个数则决定曲线的形状, 或者说平滑程度。当节点的个数为2时, 得到的拟合曲线就是一条直线。geom_ribbon(data=HR, aes(age,ymin = lower, ymax = upper),alpha = 0.1,fill="red") #优化曲线。fit
R语言基于cox风险回归的限制性立方样条RCS
最新发布
09-17
R语言中的`coxph()`函数主要用于执行 Cox 危险比例模型（也称为Cox回归），这是一种常用的生存分析方法，用于研究某些变量对生存时间的影响。而`rcs()`函数是`survival`包提供的，它特别用于Cox模型中引入限制性立方样条（Restricted Cubic Splines, RCS）。 限制性立方样条是一种非参数插值技术，在Cox模型中可以用来创建连续的风险预测函数，同时避免过度拟合。通过将连续变量转换为几个分段线性函数，RCS允许我们控制风险曲线的变化形状。RCS中的“限制”通常指的是参数的数量预先设定，这有助于提高模型解释性和稳定性。 在R中使用`rcs()`的基本步骤包括： 1. 导入必要的库，如`survival`和`rms`（如果需要更高级的功能）。 ```r library(survival) library(rms) ``` 2. 使用`rcs()`函数指定你要应用RCS的变量，并设置分段数。 ```r # 假设x是你的连续变量 x_rcs <- rcs(x, knots = c(0, quantile(x, seq(0.25, 0.75, by=0.25)), n.knots = 4) # 设置4个内点 ``` 3. 将RCS对象添加到Cox模型中。 ```r fit_cox_rcs <- coxph(Surv(time, status) ~ x_rcs + other_variables, data = your_data) ```
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