基于MATLAB的三维电镜图绘制方法

目录

一 引言

二 三维图像生成原理

2.1 原理简介

2.2 MATLAB代码

三 代码分析

1. 读取图像

2. 将图像转换为灰度图像

 3. 计算灰度图像的梯度

4. 创建二维网格坐标

 5. 转换数据为高度值

6. 创建立体图像窗口 

 7. 显示立体图像

8. 隐藏坐标轴 

 9. 显示原始图像

四 运行结果

五 改进方法 

1. 添加注释和解释

2. 参数化路径和文件名

3. 处理灰度图像

4. 可视化改进

5. 错误处理

6. 封装为函数


一 引言

常规的电子显微镜图片(包括扫描电镜,透射电镜等)的图像通常是黑白的,如果能将电子显微镜拍摄的图像(特别是球差电镜下拍摄的原子相)转为三维图像不仅在视觉上更美观,同时在科学研究和材料工程中具有重要意义,如:

更精确地理解材料结构:三维图像可以提供更全面的原子排列和晶格结构信息,这对于研究材料的物理和化学特性至关重要。

分析缺陷和缺陷分布:通过三维图像,可以更清楚地观察和分析材料中的缺陷(如空位、错位、位错等)以及这些缺陷在材料中的分布和相互作用。

改进材料设计:详细的三维结构信息有助于工程师和科学家优化材料设计,提高材料性能。例如,在电催化剂中,可以通过了解活性位点的三维结构来提高催化效率。

理解材料行为和性能:材料的许多性质,如机械强度、导电性和化学反应性,都是由其微观结构决定的。三维图像可以揭示这些结构与性能之间的关系,帮助预测和改进材料性能。

纳米技术和纳米制造:在纳米尺度上,三维图像对纳米材料和器件的设计和制造至关重要。它可以帮助确定纳米结构的精确几何形状和尺寸,从而实现更高的制造精度和功能性。

促进模拟和建模:三维图像为计算模拟和建模提供了真实的结构数据,有助于更准确地预测材料的行为和性能。

总之,将电子显微镜拍摄的图像转为三维图像能够提供更丰富、更详细的材料结构信息。因此,本文基于MATLAB代码来绘制电镜图的三维图像,通过运行代码可在电脑上一键生成所选电镜图片对应的三维图像,相比于操作其他软件,具有便携,快捷的优点。

二 三维图像生成原理

2.1 原理简介

将图像处理为三维图像的原理是通过一系列步骤将二维图像的数据转化为三维表面模型。首先,将彩色图像转换为灰度图像以简化数据处理,然后计算灰度图像的梯度以突出图像中的边缘和细节。接下来,创建一个与图像尺寸相对应的二维网格坐标,用于表示图像在三维空间中的位置。将梯度值或亮度值映射为高度值,使每个像素对应一个高度,从而形成三维表面。最后,利用网格坐标和高度值绘制三维曲面图,通过三维视觉效果更直观地展示图像的细节和结构。

2.2 MATLAB代码

% 读取图像
tif_image = imread('E:/15.png');

% 将图像转换为灰度图像
gray_image = rgb2gray(tif_image);

% 计算灰度图像的梯度
gradient_image = imgradient(gray_image);

% 创建三维立体图像
[X, Y] = meshgrid(1:size(gradient_image, 2), 1:size(gradient_image, 1));
Z = double(gradient_image);

% 创建立体图像窗口
figure('Renderer', 'painters');

% 显示立体图像
surf(X, Y, Z, 'EdgeColor', 'none', 'FaceColor', 'interp');
colormap jet;
% colorbar;

% 隐藏坐标轴
axis off;

% 显示原始图像
figure;
imshow(tif_image);

通过将第一行中图片的目录改成所需处理图片对应的目录即可运行该代码。

三 代码分析

这段代码的主要目的是将一幅图像转换为三维立体图像,并在图像窗口中显示原始图像和三维立体图像。以下是对代码的详细分析:

1. 读取图像

tif_image = imread('E:/15.png');
  • 功能:读取指定路径的图像文件,并将其存储在变量 tif_image 中。
  • 函数imread 用于从文件读取图像。
  • 输入:图像文件的路径。
  • 输出:存储图像数据的矩阵。

2. 将图像转换为灰度图像

gray_image = rgb2gray(tif_image);
  • 功能:将彩色图像转换为灰度图像。
  • 函数rgb2gray 用于将 RGB 图像转换为灰度图像。
  • 输入:RGB 图像矩阵 tif_image
  • 输出:灰度图像矩阵 gray_image

 3. 计算灰度图像的梯度

gradient_image = imgradient(gray_image);
  • 功能:计算灰度图像的梯度,以突出显示图像中的边缘和细节。
  • 函数imgradient 用于计算图像的梯度幅度。
  • 输入:灰度图像矩阵 gray_image
  • 输出:梯度图像矩阵 gradient_image,其中每个像素表示梯度幅度。

4. 创建二维网格坐标

[X, Y] = meshgrid(1:size(gradient_image, 2), 1:size(gradient_image, 1));
  • 功能:生成一个二维网格坐标矩阵,用于表示图像在三维空间中的位置。
  • 函数meshgrid 用于创建二维网格坐标。
  • 输入:图像的宽度和高度(像素数)。
  • 输出:二维网格坐标矩阵 XY,表示每个像素的水平和垂直位置

 5. 转换数据为高度值

Z = double(gradient_image);
  • 功能:将梯度图像转换为双精度类型,用于表示高度值。
  • 输入:梯度图像矩阵 gradient_image
  • 输出:双精度类型的高度矩阵 Z

6. 创建立体图像窗口 

figure('Renderer', 'painters');
  • 功能:创建一个新的图形窗口,并设置渲染器为 painters
  • 函数figure 用于创建图形窗口。
  • 输入:渲染器类型 'Renderer', 'painters'
  • 输出:图形窗口。

 7. 显示立体图像

surf(X, Y, Z, 'EdgeColor', 'none', 'FaceColor', 'interp');
colormap jet;
% colorbar;
  • 功能:在图形窗口中显示三维立体图像。
  • 函数
    • surf 用于绘制三维曲面图。
    • colormap 用于设置颜色映射。
    • colorbar(已注释)用于显示颜色条。
  • 输入
    • XY:网格坐标。
    • Z:高度值。
    • 'EdgeColor', 'none':不显示边缘颜色。
    • 'FaceColor', 'interp':使用插值面颜色。
  • 输出:三维曲面图。

8. 隐藏坐标轴 

axis off;
  • 功能:隐藏图形窗口中的坐标轴。
  • 函数axis 控制坐标轴的显示。
  • 输入off 表示隐藏坐标轴。
  • 输出:无坐标轴的图形窗口。

 9. 显示原始图像

figure;
imshow(tif_image);
  • 功能:在新的图形窗口中显示原始图像。
  • 函数
    • figure 用于创建新的图形窗口。
    • imshow 用于显示图像。
  • 输入:原始图像矩阵 tif_image
  • 输出:图像显示窗口。

这段代码通过读取图像文件、转换为灰度图像、计算梯度、生成二维网格坐标、转换为高度值,并在图形窗口中显示三维立体图像和原始图像,从而实现二维图像到三维立体图像的转换和展示。

四 运行结果

五 改进方法 

以上代码已经很好地实现了将二维图像转换为三维立体图像并进行展示的功能。以下是一些改进策略,可以进一步提升代码的可读性、可扩展性和功能性:

1. 添加注释和解释

虽然代码已经相对清晰,但添加更多注释和解释可以帮助其他人更容易理解代码的目的和功能。

2. 参数化路径和文件名

将图像路径和文件名参数化,便于后续修改和复用。

3. 处理灰度图像

在处理灰度图像之前,检查图像是否已经是灰度图像,如果是则跳过转换步骤。

4. 可视化改进

为三维立体图像和原始图像添加标题,调整颜色映射,打开注释的颜色条。

5. 错误处理

添加错误处理机制,以防止在读取文件或处理图像时出现问题。

6. 封装为函数

将主要的图像处理和显示过程封装为函数,便于复用和扩展。

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