linuxmint 20.3 利用conda安装RDkit、Jupyter notebook、Spyder

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软件简介

安装RDkit

安装Jupyter notebook

安装Spyder

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软件简介

简单介绍一下，RDKt 是为了建立ADMET、生物活性等性质的预测模型而开发的化学信息python包，可以用来研究小分子化合物药物，对其结构进行操作、展示，开展分子量、化学描述符等计算

Jupyter notebook和Spyder是两种python语言开发环境，RDKit中文教程网站 推荐使用Jupyter notebook，因为Jupyter notebook可以集合代码，结果和说明文档于一体，比较直观

注：安装语言开发环境一定要在你另外创建的用于工作的python环境下安装，安装到其他环境再切换回工作环境是无法使用的

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安装RDkit

由于之前已经安装anaconda，所以这里直接从conda安装RDkit

打开终端，创建环境（名字可以自行更改）

conda create -c conda-forge -n rdkit2203 rdkit
#新建一个名为rdkit2203的rdkit环境

创建成功，输入conda activate rdkit2203 激活rdkit环境

conda env list 查看所有conda环境，带*的为目前所在环境，刚创建的rdkit环境

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安装Jupyter notebook

 输入命令进行安装

conda install jupyter notebook

 

 在终端输入Jupyter notebook后，会打开网页，说明安装成功

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安装Spyder

 输入命令进行安装

conda install spyder

 在终端输入spyder打开spyder界面，说明安装成功

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