在生物与医药领域,某种先导化合物的IC50值非常重要,而通过GraphPad Prism软件计算IC50值,是一种十分简便的方法,其导出的数据图,可以直接用来发文章。
下面简单介绍一下用GraphPad Prism计算IC50方法,以及用GraphPad Prism作图
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一、数据转化
首先,打开软件,选项中选择x和y的第一项
x中输入给药浓度,y中输入细胞相对存活率/死亡率(%),此处随便输入一组
选择【分析】→【变换、规范】中选择变换浓度(x),将x数值变换为以10为底的相应对数值
二、计算IC50
再次点击分析选项,选择【xy分析】中的“非线性回归(曲线拟合)”
选择Dose-response-Inhibition中的log(inhibitor)vs.normalized response--Variable slope
可以看到IC50值已经展现出来了
三、IC50图像
点击【图】选项下的第二个,就可以看到自动生成的IC50图像,在这里,我们可以稍作修改,美化图像
点击任务栏【更改】中的第一行第二个,如图
将原点设置为x=-1,移到最左侧
【左y轴】取消自动确定范围,将最大值改为100;添加y=50的虚线,方便表示IC50位置
确认后,图片变为如下效果
再将轴标题和图标标题更改一下就可以了