anaconda3与rdkit安装教程（Linux系统）

一、安装anaconda

1. 下载Anaconda Linux版本

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh

或下载后上传至服务器

附下载好的百度云资源：

链接：百度网盘 请输入提取码  

提取码：nuwq

2. 执行sh Anaconda*.sh

根据提示，依次输入yes，ENTER

3. 执行vi /root/.bashrc

用vi打开.bashrc文件，默认进入命令模式，输入“i”进入插入模式，在文件的最后加上以下语句，按ESC键，执行: x命令保存并退出。

etup="$('/home/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"

if [ $? -eq 0 ]; then

        eval "$__conda_setup"

else

        if [ -f "/home/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then

                . "/home/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"

        else

                export PATH="/home/anaconda3/bin:$PATH"

        fi

fi

unset __conda_setup

# <<< conda initialize <<<

4. 关掉Terminal，重新打开，重新进入终端使以上内容生效

5. 进入conda环境

依次执行以下命令

cd anaconda3

cd bin

. ./activate

这两条指令是进入conda环境，其中第2条指令第一个点相当于source，第二个点代表当前路径

二、安装rdkit

更新conda：

conda update conda，先把conda更新到最新版，这步很快

更新anacoda:

conda update anaconda，把anaconda更新的新版，这步耗时

conda update –all

更改python版本至3.9.7

conda install -c cctbx202112 python

安装rdkit版本2021.03.4

conda install -c conda-forge rdkit

三、查看rdkit版本

import rdkit

print (rdkit.__version__)